糜子黄、黑种皮遗传及转录组学分析

同源异型域-亮氨酸拉链(homedomain-leucine zipper，HD-Zip)转录因子广泛参与植物的生长发育和抗胁迫过程。该研究通过生物信息学方法对青稞HD-Zip基因家族进行全基因组分析鉴定，并采用qRT-PCR技术分析非生物胁迫下该基因的表达特性，为深入探讨青稞HD-Zip转录因子的生物学功能及其在高原作物抗逆育种中的应用奠定基础。结果表明：(1)成功从青稞基因组中共鉴定出41个HD-Zip基因家族成员，依次命名为i>HvvHD-ZipⅠ-1~Ⅳ-13，且这些基因在7条染色体上呈不均匀分布。(2)理化性质分析发现，HvvHD-Zip蛋白包含197～885个不等的氨基酸残基；分子量范围在19 914.36～94 014.87 Da；亚细胞定位表明HvvHD-Zip蛋白都位于细胞核。(3)根据多序列比对、系统进化、基因结构和保守基序差异将其聚为4个亚家族，各亚家族分类特征与系统聚类结果一致。(4)顺式作用元件预测分析发现，i>HvvHD-Zip基因启动子中含有11种植物激素和胁迫响应元件。(5)qRT-PCR结果显示，HvvHD-Zip Ⅰ、Ⅱ、Ⅳ亚家族基因对各胁迫响应明显；与根组织相比，多数i>HvvHD-Zip基因在叶组织中响应明显(上调或下调)；与冷和盐胁迫相比，i>HvvHD-Zip各基因对旱胁迫响应较强。