RAD-seq技术及其在昆虫学研究中的应用 |
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引用本文: | 魏书军,李冰艳,曹利军,朱家颖. RAD-seq技术及其在昆虫学研究中的应用[J]. 昆虫学报, 2016, 0(7): 767-774. DOI: 10.16380/j.kcxb.2016.07.009 |
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作者姓名: | 魏书军 李冰艳 曹利军 朱家颖 |
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作者单位: | 1. 北京市农林科学院植物保护环境保护研究所,北京,100097;2. 北京市农林科学院植物保护环境保护研究所,北京100097;西南林业大学,云南省森林灾害预警与控制重点实验室,昆明650224;3. 西南林业大学,云南省森林灾害预警与控制重点实验室,昆明650224 |
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基金项目: | 北京市自然科学基金项目(6162010),国家自然科学基金项目(31472025),国家重点基础研究发展计划项目(2013CB127600) |
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摘 要: | 限制性酶切位点关联DNA测序技术(restriction-site-associated DNA sequencing,RAD-seq)是在二代测序技术基础上发展起来的一种简化基因组技术(reduced-representation genome sequencing,RRGS)。RAD-seq利用限性核酸内切酶使基因组片段化,经过修饰后连接含标记的接头构建文库并进行测序。因其具有操作简单、实验成本低、通量高等优点,在分子生态学、进化基因组学、保护遗传学等领域得到应用。目前发展起来的RAD-seq技术主要包括利用稀有酶和物理打断方式进行基因组片段化的mbRAD、利用稀有酶和常见酶组合酶切的方式进行基因组片段化的ddRAD、利用IIB型限制性内切酶得到短片段文库的2bRAD、利用同裂酶和Illumina试剂盒建库的ezRAD和完全利用Nextera试剂盒建库的nextRAD。本文对每种RAD-seq技术的特点及其在昆虫种群遗传学、群落生态学、物种界定、系统发育和遗传连锁图谱构建等研究领域的应用进行了综述。
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关 键 词: | RAD-seq 昆虫学 种群遗传学 物种界定 系统发育 遗传连锁图谱 |
RAD-seq and its application in entomological research |
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Abstract: | |
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Keywords: | RAD-seq entomology population genetics species delimitation phylogeny genetic linkage map |
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