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副溶血性弧菌重复序列-PCR分型研究
引用本文:金莉莉,董 雪,王秋雨,李 雪,吴 琼,李继耀.副溶血性弧菌重复序列-PCR分型研究[J].微生物学报,2008,35(3):0389-0394.
作者姓名:金莉莉  董 雪  王秋雨  李 雪  吴 琼  李继耀
作者单位:辽宁大学生命科学学院 沈阳 110036;沈阳市疾病预防控制中心 沈阳 110037;辽宁大学生命科学学院 沈阳 110036;辽宁大学生命科学学院 沈阳 110036;辽宁大学生命科学学院 沈阳 110036;沈阳市疾病预防控制中心 沈阳 110037
基金项目:沈阳市科技局资助项目(No. 1063231-3-00)
摘    要:利用基因外重复回文序列-PCR(REP-PCR)和肠细菌基因间共有重复序列-PCR(ERIC-PCR)技术, 对副溶血性弧菌进行了分子分型研究和亲缘关系的探讨, 并使用Hunter和Gaston方法计算分辨力指数。结果显示40株副溶血性弧菌分离株均可扩增产生可重复的DNA指纹图谱, 并且不同菌株基因组DNA的扩增条带具有多态性。根据SPSS10.0软件得出的树状图结果, REP-PCR可以把40株菌分为21个型, 分辨力指数可达到0.953, 优势菌型为G1型; ERIC-PCR可将40株菌分成4个型, 分辨力指数为0.5。研究显示重复序列-PCR方法可以用于该菌分型分析, REP-PCR具有较好的分型能力。在两种PCR的DNA指纹图谱中, 血清型O1群与O3群主条带均非常相似, 表明它们之间亲缘关系密切。

关 键 词:副溶血性弧菌    基因外重复回文序列-PCR    肠细菌基因间共有重复序列-PCR    分型    亲缘关系

Typing of Vibrio parahaemolyticus by Repetitive Element Sequence-based PCR
JIN Li-Li,DONG Xue,WANG Qiu-Yu,LI Xue,WU Qiong and LI Ji-Yao.Typing of Vibrio parahaemolyticus by Repetitive Element Sequence-based PCR[J].Acta Microbiologica Sinica,2008,35(3):0389-0394.
Authors:JIN Li-Li  DONG Xue  WANG Qiu-Yu  LI Xue  WU Qiong and LI Ji-Yao
Institution:Life School of Liaoning University, Shenyang 110036;Shenyang Center for Disease Control and Prevention, Shenyang 110037;Life School of Liaoning University, Shenyang 110036;Life School of Liaoning University, Shenyang 110036;Life School of Liaoning University, Shenyang 110036;Shenyang Center for Disease Control and Prevention, Shenyang 110037
Abstract:
Keywords:Vibrio Parahaemolyticus  Repetitive extragenic palindromic elements-PCR  Enterobacterial repetitive intergenic consensus sequences-PCR  Typing  Genetic relationship
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