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大肠杆菌σ70启动子的识别
引用本文:张颖,贾芸,吕军. 大肠杆菌σ70启动子的识别[J]. 生物物理学报, 2007, 23(6): 475-481
作者姓名:张颖  贾芸  吕军
作者单位:内蒙古工业大学理学院物理系,呼和浩特010051
基金项目:内蒙古工业大学校内基金;内蒙古工业大学校科研和教改项目
摘    要:应用多样性增量结合二次判别分析(Increment of Diversity with Quadratic Discriminant analysis,IDQD)方法,对大肠杆菌σ^70启动子进行识别。使用受试者操作特性(receiver operating characteristic,ROC)曲线和精度召回率曲线(Precision Recall Curves,PRC)进行性能评估。10-fold交叉检验给出,在正负集之比为1:1时,ROC曲线下面积和PRC曲线下面积均为95%。结果表明,IDQD算法有能力应用于原核启动子的识别。识别精度高于现有算法。

关 键 词:大肠杆菌  启动子  多样性增量  二次判别分析
收稿时间:2007-03-14
修稿时间:2007-03-14

The Recognition of σ70 Promoters in Escherichia coli K-12
ZHANG Ying,JIA Yun. The Recognition of σ70 Promoters in Escherichia coli K-12[J]. Acta Biophysica Sinica, 2007, 23(6): 475-481
Authors:ZHANG Ying  JIA Yun
Abstract:
Keywords:Escherichia coli K-12   Promoter   Increment of Diversity   Quadratic Discriminant analysis
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