猪β2m二级结构预测及同源模建 |
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作者姓名: | 程德淑 赵学勇 陈茜茜 宋硕 李鹏 高凤山 |
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作者单位: | 大连大学生物工程学院,辽宁,大连,116622 |
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基金项目: | 大连大学本科生创新教育基金项目 |
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摘 要: | 目的:研究猪β2m的结构.方法:应用EXPASY服务器(http://www.expasy.ch/tools)上的SOPMA法对β2m进行二级结构的预测,并与人的β2m的氨基酸和二级结构成分比较,在此基础上同源模建β2m的三级结构.结果:β2m二级结构成分α螺旋、β折叠、转角和无规则卷曲的数目分别为5、36、5和52,与人β2m相应二级结构的符合率分别达到100%(α螺旋)、92.3%(B折叠)、71.7%(转角)和92.3%(无规则卷曲),且二级结构的同源率要大于氨基酸的同源率.同源模建分析表明猪和人的3D结构也非常相似,只是存在个别氨基酸的差异.结论:猪和人β2m空间结构相似.
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关 键 词: | β2m 二级结构 同源模建 |
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