| 金铁锁转录因子ptMYC2的克隆和生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 孟文俊,张爱丽,蒋乐晓,朱文杰,段丽,钱子刚. 金铁锁转录因子ptMYC2的克隆和生物信息学分析[J]. 广西植物, 2019, 39(10): 1350-1358 |
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| 作者姓名： | 孟文俊 张爱丽 蒋乐晓 朱文杰 段丽 钱子刚 |
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| 作者单位： | 云南中医学院 中药材优良种苗繁育工程中心,昆明,650500;云南中医学院 中药材优良种苗繁育工程中心,昆明,650500;云南中医学院 中药材优良种苗繁育工程中心,昆明,650500;云南中医学院 中药材优良种苗繁育工程中心,昆明,650500;云南中医学院 中药材优良种苗繁育工程中心,昆明,650500;云南中医学院 中药材优良种苗繁育工程中心,昆明,650500 |
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| 基金项目： | 云南省科学技术厅-云南中医学院应用基础联合专项项目(2017FF117-001); 云南省科学技术厅-云南中医学院应用基础联合专项项目(2017FF117-030); 云南省应用基础青年项目(2015FD036)[Supported by Yunnan Provincial Department of Science and Technology-Yunnan University of Traditional Chinese Medicine Applied Foundation Joint Special Program(2017FF117-001); Yunnan Provincial Department of Science and Technology-Yunnan University of Traditional Chinese Medicine Applied Foundation Joint Special Program(2017FF117-030); Yunnan Applied Basic Youth Program(2015FD036)]。 |
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| 摘 要： | 金铁锁是 “云南白药”等多种中成药的重要组成,其有效成分为三萜皂苷,MYC类转录因子在调节植物三萜类次生代谢积累中有重要作用。为研究ptMYC2 基因在金铁锁三萜皂苷合成代谢途径的调控机制,该研究基于金铁锁转录组测序数据,克隆得到ptMYC2转录因子的两个全长基因; 通过生物信息学软件对两条转录因子的同源性、理化性质、疏水性、跨膜结构、亚细胞定位、结构域、靶基因结合位点等进行初步预测分析。结果表明:两条转录因子所编码的蛋白属于亲水性蛋白,不存在跨膜区域,均是非分泌蛋白质,且不存在信号肽; 两条转录因子的亚细胞定位于细胞核; 结构域分析显示,两个基因都含有bHLH家族结构域; 预测得到金铁锁三萜皂苷合成途径中HMGR、FPS、SE、β-AS等基因的启动子可能存在与MYC2结合的E-box特异性结合位点。该研究结果将为进一步研究ptMYC2基因在金铁锁三萜皂苷合成代谢途径的调节机制奠定基础。
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| 关 键 词： | 金铁锁 转录因子 MYC2 三萜皂苷 生物合成途径 生物信息学分析 |
| 收稿时间： | 2019-01-29 |
Cloning and bioinformatics analysis of Psammosilene tunicoides transcription factor ptMYC2 |
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| MENG Wenjun,ZHANG Aili,JIANG Lexiao,ZHU Wenjie,DUAN Li,QIAN Zigang. Cloning and bioinformatics analysis of Psammosilene tunicoides transcription factor ptMYC2[J]. Guihaia, 2019, 39(10): 1350-1358 |
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| Authors: | MENG Wenjun ZHANG Aili JIANG Lexiao ZHU Wenjie DUAN Li QIAN Zigang |
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| Affiliation: | Certer for Reproducing Fine Varieties of Chinese Medicinal Plants, Yunnan University of Traditional Chinese Medicine, Kunming 650500, China |
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