| 裸子植物psbA基因分子进化式样的研究 |
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| 引用本文： | 森林,余坤,胡志刚,汪文杰,徐雷,刘合刚,潘宏林. 裸子植物psbA基因分子进化式样的研究[J]. 热带亚热带植物学报, 2016, 24(2): 151-159 |
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| 作者姓名： | 森林 余坤 胡志刚 汪文杰 徐雷 刘合刚 潘宏林 |
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| 作者单位： | 1. 湖北中医药大学, 中药资源与中药复方教育部重点实验室, 武汉 430065;2. 湖北中医药大学, 药学院, 武汉 430065,1. 湖北中医药大学, 中药资源与中药复方教育部重点实验室, 武汉 430065;2. 湖北中医药大学, 药学院, 武汉 430065,湖北中医药大学, 药学院, 武汉 430065,湖北中医药大学, 药学院, 武汉 430065,湖北中医药大学, 药学院, 武汉 430065,湖北中医药大学, 药学院, 武汉 430065,湖北中医药大学, 药学院, 武汉 430065 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金青年项目(31500260);湖北中医药大学教育部重点实验室科研启动经费(5114000914)资助 |
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| 摘 要： | 为阐明裸子植物对陆生生境生态响应的分子机制,以新近的裸子植物分类系统为指导,基于psb A基因编码全序列对4亚纲53种代表植物进行分子进化分析。首先,依据"放松分子钟"模型重建裸子植物在时间尺度下系统发育关系;其次,采用6个模型(MEC/JTT、MEC/cp REV、M5、M7、M8、M8a)估测氨基酸位点ω值,并对各模型结果进行统计检测;随后,利用Bootstrap方法检PSBA蛋白内部氨基酸位点的共进化动态。结果表明,系统树提示的物种分化历程支持前期分类结果;光合系统反应中心核心PSBA蛋白有3个氨基酸位点(13、19和243)曾经受正选择压力;PSBA蛋白内部有多对氨基酸位点间构成了共进化网络。因此,psb A基因编码序列具有作为描绘裸子植物系统发育关系标记的潜力,PSBA蛋白部分位点经历了适应性进化,通过位点间共进化网络协同作用方式辅助裸子植物响应陆生生境。
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| 关 键 词： | 裸子植物 响应 机制 放松分子钟模型 适应性进化 共进化 |
| 收稿时间： | 2015-05-12 |
| 修稿时间： | 2015-09-06 |
Molecular Evolutionary Patterns of the psbA Gene in Gymnosperms |
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| SEN Lin,YU Kun,HU Zhi-gang,WANG Wen-jie,XU Lei,LIU He-gang and PAN Hong-lin. Molecular Evolutionary Patterns of the psbA Gene in Gymnosperms[J]. Journal of Tropical and Subtropical Botany, 2016, 24(2): 151-159 |
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| Authors: | SEN Lin YU Kun HU Zhi-gang WANG Wen-jie XU Lei LIU He-gang PAN Hong-lin |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Gymnosperms Response Mechanism Relaxed molecular clock model Adaptive evolution Co-evolution |
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