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胡杨无性系幼苗响应盐胁迫的miRNA表达差异研究
引用本文:司婧娜,周韬,徐放,薄文浩,邬荣领.胡杨无性系幼苗响应盐胁迫的miRNA表达差异研究[J].植物研究,2015,35(6):836-842.
作者姓名:司婧娜  周韬  徐放  薄文浩  邬荣领
作者单位:北京林业大学计算生物学中心,林木遗传育种国家工程实验室,生物科学与技术学院,北京 100083
摘    要:植物miRNA在调控基因表达、细胞周期、生物体发育、抗逆等方面起重要作用。为研究胡杨(Populus euphratica Oliv.)的耐盐机制,以1年生胡杨无性系幼苗为材料,构建具有空间代表性的盐胁迫胡杨cDNA文库,利用二代测序技术测定NaCl胁迫下和正常培养条件下胡杨叶和根miRNA表达情况。结果表明,不同的miRNA之间表达量存在明显差异,表达丰度最高的miRNA有miR156、miR157、miR165、miR166和miR167等,合计占总表达量的90%以上。胡杨根部存在特异表达的miRNA,在整个耐盐调控机制中发挥着生理调节、分子调控和信号传导等极为重要的作用。盐处理样品中发现大量响应盐胁迫的miRNA,对这些转录因子进行靶基因预测和注释后,发现很多盐胁迫响应的miRNA与NAC和SPL等重要转录因子家族相关,与前人的结论一致,另外还发现许多miRNA的调控对象是ATP酶和激素响应因子。

关 键 词:高通量测序  miRNAs  胡杨  盐胁迫  

Salt-responsive MicroRNAs in Populus euphratica by Deep Sequencing
SI Jing-Na,ZHOU Tao,XU Fang,BO Wen-Hao,WU Rong-Ling.Salt-responsive MicroRNAs in Populus euphratica by Deep Sequencing[J].Bulletin of Botanical Research,2015,35(6):836-842.
Authors:SI Jing-Na  ZHOU Tao  XU Fang  BO Wen-Hao  WU Rong-Ling
Institution:Center for Computational Biology,National Engineering Laboratory for Tree Breeding,College of Biological Sciences and Biotechnology,Beijing Forestry University,Beijing 100083
Abstract:
Keywords:high-throughput sequencing  microRNA  Populus euphratica  salt stress  
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