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大肠杆菌合成启动子的构建及在顺,顺-粘康酸生物合成中的应用
引用本文:吴元庆,张媛媛,涂然,刘浩,王钦宏.大肠杆菌合成启动子的构建及在顺,顺-粘康酸生物合成中的应用[J].生物工程学报,2013,29(6):760-771.
作者姓名:吴元庆  张媛媛  涂然  刘浩  王钦宏
作者单位:1. 天津科技大学生物工程学院,天津300457;中国科学院天津工业生物技术研究所中国科学院系统微生物工程重点实验室,天津300308
2. 中国科学院天津工业生物技术研究所中国科学院系统微生物工程重点实验室,天津,300308
3. 天津科技大学生物工程学院,天津,300457
基金项目:国家重点基础研究发展计划 (973计划) (No. 2011CBA00800),天津市科学技术委员会工业生物技术专项 (No. 10ZCKFSY05300),中国科学院科研装备项目 (No. YZ201153) 资助。
摘    要:启动子是基因表达调控的重要元件.在代谢工程和合成生物学研究中,经常需要利用不同强度的启动子对代谢途径进行精细调控,来实现代谢平衡,降低中间产物积累,提高目标产物合成.然而目前可获得的启动子难以满足以上要求,而且不同来源的启动子通用性差,缺乏标准化.针对这些问题,设计了1条88个碱基对的启动子,包含典型的-35区、-10区以及核糖体结合区.同时,在转录起始位点上游6个碱基、-35与-10区间隔区14个碱基对中引入简并序列,构建了合成启动子文库.利用合成启动子控制红色荧光蛋白mCherry的表达强度,经过两轮筛选,从5 000多个克隆中获得了720个不同强度的启动子.随机挑选35条不同强度的启动子进行测序分析,结果表明不同强度的启动子具有碱基偏好性.对于强启动子,-13位点嘌呤碱基出现频率高,转录起始区除-4位点外,嘧啶碱基出现的频率高于嘌呤碱基,而-10区与-35区间14个位点的嘌呤碱基与嘧啶碱基出现频率大致相当.最后选取5条不同强度启动子应用于顺,顺-粘康酸合成途径调控优化,结果显示不同强度的启动子可以调节目标产物顺,顺-粘康酸的合成和中间产物儿茶酚的积累.

关 键 词:合成启动子  精细调控    顺-粘康酸  代谢工程  合成生物学
收稿时间:2012/12/27 0:00:00

Construction of synthetic promoters for Escherichia coli and application in the biosynthesis of cis,cis-muconic acid
Yuanqing Wu,Yuanyuan Zhang,Ran Tu,Hao Liu and Qinhong Wang.Construction of synthetic promoters for Escherichia coli and application in the biosynthesis of cis,cis-muconic acid[J].Chinese Journal of Biotechnology,2013,29(6):760-771.
Authors:Yuanqing Wu  Yuanyuan Zhang  Ran Tu  Hao Liu and Qinhong Wang
Institution:1 College of Biotechnology, Tianjin University of Science & Technology, Tianjin 300457, China; 2 Key Laboratory of Systems Microbial Biotechnology, Tianjin Institute of Industrial Biotechnology, Chinese Academy of Science, Tianjin 300308, China;2 Key Laboratory of Systems Microbial Biotechnology, Tianjin Institute of Industrial Biotechnology, Chinese Academy of Science, Tianjin 300308, China;2 Key Laboratory of Systems Microbial Biotechnology, Tianjin Institute of Industrial Biotechnology, Chinese Academy of Science, Tianjin 300308, China;1 College of Biotechnology, Tianjin University of Science & Technology, Tianjin 300457, China;2 Key Laboratory of Systems Microbial Biotechnology, Tianjin Institute of Industrial Biotechnology, Chinese Academy of Science, Tianjin 300308, China
Abstract:
Keywords:synthetic promoter  fine tuning  cis  cis-muconic acid  metabolic engineering  synthetic biology
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