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口蹄疫病毒China/99基因组RNA序列测定及比较分析
作者姓名:张显升  刘在新  赵启组  常惠芸  谢庆阁
作者单位:中国农业科学院兰州兽医研究所病毒室,兰州 730046
基金项目:国家“973”资助项目(批准号:G1999011901)
摘    要:测定了1999年我国口蹄疫流行毒株(China/99, Tibet)基因组全序列, China/99基因组RNA全长8173个核苷酸(nt), 开放阅读框含盖6999 nt, 编码2332个氨基酸的聚合蛋白. 5′和3′非翻译区(UTR)分别长1081和93 nt. China/99与12株参考株基因组序列比较发现: China/99与英国2001年流行毒、海南和西藏1999年流行毒1d基因的序列同源性高达97%以上, 均属泛亚毒株; 在牛和猪FMDV的功能未知区、p2p3区存在较为显著的核苷酸序列差异, 3a基因最为显著; l, 1a, 1b, 2a, 2c, 3b3d基因没有核苷酸缺失或插入现象, 属于病毒必需基因; 口蹄疫病毒S片段、功能未知区和内部核糖体进入位点(IRES)二级结构均可分为3种类型. S片段和3′UTR折叠成一个三叶草类似结构.

关 键 词:China/99  参考毒株  基因组  序列分析  口蹄疫病毒
收稿时间:2002-11-29
修稿时间:2002-11-29
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