| 口腔扁平苔藓患者的CIITA基因单倍型分析 |
| |
| 引用本文： | 屈爽,苗运博,吴丹,孙茂,刘青,杨安钢,吴元明,王立锋.口腔扁平苔藓患者的CIITA基因单倍型分析[J].现代生物医学进展,2015,15(25):4813-4818. |
| |
| 作者姓名： | 屈爽 苗运博 吴丹 孙茂 刘青 杨安钢 吴元明 王立锋 |
| |
| 作者单位： | 第四军医大学1 学员一旅；2 基础医学院生物化学与分子生物学教研室；
3 口腔医院粘膜科；4 基础医学院免疫学教研室 |
| |
| 基金项目： | 国家自然科学基金项目(30901359) |
| |
| 摘 要： | 目的:分析CIITA基因中单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)的单倍型与口腔扁平苔藓(Oral Lichen Planus,OLP)之间的关系,并探讨计算单倍型的新方法。方法:在得到42名患者与86名对照的CIITA基因中15个SNP位点的信息后,通过Haploview和SHEsis软件以及本研究组设计的频数计数法进行单倍型分析。组间比较使用χ2检验,并以P=0.05作为统计检验标准。结果:在本研究群体中,CIITA基因上的15个SNP位点能够形成两个单体域(haploblock),其中由位点rs6498124,rs11647384和rs4774所组成的单倍型GAC在三种单倍型分析方法中均显示出显著的统计学差异(Haploview:Chi2=6.127,P=0.013;SHEsis:Chi2=6.469 P=0.011;频数计数法:Chi2=5.460,P=0.019)。结论:在由CIITA基因的SNP位点rs6498124,rs11647384,rs4774组成的单体域中,单倍型GAC对OLP的患病具有潜在的保护性。频数计数法显示,rs4774位点本身的保护性及其与同一单体域内另外两个位点之间的完全连锁不平衡关系是单体型GAC显示出保护性的主要依据。提示单倍型对疾病易感性的解释在于其中的特定SNP位点等位基因型,及其该位点与其它相关位点间的连锁不平衡关系。
|
| 关 键 词： | OLP CIITA SNP Haploview SHEsis 单倍型分析 |
Haplotype Analysis of CIITA Gene in Oral Lichen Planus |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | OLP CIITA SNP Haploview SHEsis Haplotype analysis |
| 本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录！ |
| 点击此处可从《现代生物医学进展》浏览原始摘要信息 |
| 点击此处可从《现代生物医学进展》下载免费的PDF全文 |
|
