β-catenin调控小鼠肾脏发育的基因表达谱富集分析

敲除β-catenin基因的第3号外显子可使其过表达。以往很多研究主要通过基因表达谱分析β-catenin过表达对肾脏发育产生的影响,并鉴定了多个关键基因。但相关通路及相关通路间的共表达模式(co-expression pattern)很少被涉及。本研究选取公共数据库GEO(gene expression omnibus)中和小鼠β-catenin过表达肾脏转录组密切相关微阵列(microarray)数据集作为研究对象,并进行GSEA(gene set enrichment analysis)分析,筛选相关转录因子。我们鉴定出了63条被β-catenin上调的通路如Notch信号通路(Notch signaling pathway),以及43条被下调的通路如ABC转运体(ABC transporters)等通路。最终,我们构建了包含有核心基因和转录因子如STATs的相关通路共表达网络,我们的研究结果将帮助我们更好地在全基因组层面上了解β-catenin对于小鼠肾脏发育的调控作用。