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香猪5个单核苷酸位点的多态性与产仔数的关联分析
摘    要:为了寻找影响猪产仔数的功能基因,本研究选取5个候选SNP位点CASI0003452、DIAS0001380、ALGA0071919、MARC0052565和ALGA0045832,采用等位基因特异PCR方法对候选位点的多态性变化进行群体研究。结果表明:香猪群体中C~(452)位点以BB基因型为主,低产群的B等位基因频率明显高于高产群(p0.05),两个香猪群体的B等位基因频率明显高于大白猪(p0.05)。D~(380)位点,两个香猪群的A等位基因频率低于于大白猪,且与乳头数呈弱的正相关;香猪和大白猪群体中A~(919)和M~(565)位点在香猪和大白猪群体中的基因型均为CC型,没有多态性;A~(832)位点两个香猪群A等位基因频率明显低于大白猪(p0.05)。经测序证实D~(380)位点处于C1GALT1基因外显子1中,属于同义密码子突变(GCC→GCU),存在密码子偏好性,可能影响香猪C1GALT1基因的表达,可能与香猪的性早熟有关。C~(452)位于PDIA4基因内含子4中,已知PDIA4基因直接影响繁殖的主效基因ER的结构和功能,推测C~(452)位点的多态性有可能影响PDIA4蛋白的表达,进而干扰卵母细胞成熟、受精及胚胎的早期发育等生理过程。

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