| 模拟蛋白质折叠过程的新算法研究 |
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| 引用本文： | 张天驰,张菁.模拟蛋白质折叠过程的新算法研究[J].生物信息学,2011,9(2):142-145. |
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| 作者姓名： | 张天驰 张菁 |
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| 作者单位： | 哈尔滨工程大学计算机科学与技术学院,哈尔滨,150001 |
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| 基金项目： | 黑龙江省自然科学基金(留学回国基金)，黑龙江省博士后基金 |
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| 摘 要： | 蛋白质折叠过程模拟是当前蛋白质研究领域的一个难点问题。针对这一问题,提出了一个描述蛋白质折叠过程的算法-拟蛇算法,并且从分子振荡和分子动力学理论两个方面来证明该算法的核心函数是可行和正确的。经过实验总结出所有蛋白质空间结构都可以通过两种类型函数构造出来,提出了描述蛋白质折叠过程模型。与其它蛋白质折叠过程模拟算法的实验结果比较表明,拟蛇算法所构造的空间结构能量值最小、相似度最好。进而说明拟蛇算法和蛋白质折叠过程模型在描述蛋白质折叠过程方面具有明显优势。
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| 关 键 词： | 蛋白质折叠模拟 蛋白质结构分类 分子振动 分子动力学 |
A New Algorithm for Simulation of Protein Folding Process |
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| ZHANG Tian-chi,ZHANG Jing.A New Algorithm for Simulation of Protein Folding Process[J].China Journal of Bioinformation,2011,9(2):142-145. |
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| Authors: | ZHANG Tian-chi ZHANG Jing |
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| Institution: | ZHANG Tian-chi,ZHANG Jing*(College of Computer Science &Technology,Harbin Institute of Technology,Harbin 150001,China) |
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| Abstract: | It is a difficult problem of studying the protein folding process in the protein research field.In this paper,a new simulation algorithm-snake simulation algorithm is put forward to solve the problem.In order to prove the key function in snake simulation algorithm is correct and feasible,theory of molecule oscillation and molecule kinetics are used.In addition,bring forward a model that describes the process of protein folding,concludes that all the protein structure can be constructed by two type functions... |
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| Keywords: | Protein folding protein structure type molecule oscillation molecule kinetics |
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