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乙型、丙型流感病毒的长记忆ARFIMA模型
引用本文:刘娟,高洁.乙型、丙型流感病毒的长记忆ARFIMA模型[J].生物信息学,2011,9(2):97-101.
作者姓名:刘娟  高洁
作者单位:江南大学理学院,无锡,214122
基金项目:江南大学创新团队发展计划资助
摘    要:用时间序列模型来分析乙型、丙型这两种流感病毒,对乙流、丙流病毒DNA序列提供了一种新的时间序列模型,即CGR弧度序列。利用CGR坐标将乙流、丙流病毒DNA序列转换成CGR弧度序列,且引入长记忆ARFIMA模型去拟合这两类序列。发现随机找来的10条乙流序列,10条丙流序列都具有长相关性且拟合很好,并且还发现这两种病毒序列可以尝试用不同的ARFIMA模型ARFIMA(0,d,4)模型,ARFIMA(1,d,1)模型去识别。

关 键 词:乙型流感  丙型流感  时间序列模型  CGR  ARFIMA(p  d  q)模型

long-memory ARFIMA models for DNA sequences of influenza B,C virus
LIU Juan,GAO jie.long-memory ARFIMA models for DNA sequences of influenza B,C virus[J].China Journal of Bioinformation,2011,9(2):97-101.
Authors:LIU Juan  GAO jie
Institution:LIU Juan,GAO jie(School of Science,Jiangnan University,Wuxi 214122,China)
Abstract:In this paper,we make use of the time series model analyze the influenza B,C virus,and propose a new time series model for DNA sequence of influenza B,C virus,i.e.CGR radians series.The CGR coordinates are converted into a time series model,and a long-memory ARFIMA(p,d,q) model is introduced to simulate the time series model.We select randomly the 10 influenza B sequences and 10 influenza C sequences to analysis.we uncover in these data remarkably long-rang correlations and fit the model reasonably by ARFIM...
Keywords:CGR
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