| 基因启动子甲基化对转录因子结合的抑制作用分析方法 |
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| 引用本文： | 冯伟兴,王科俊,贺波,李 霞. 基因启动子甲基化对转录因子结合的抑制作用分析方法[J]. 生物化学与生物物理进展, 2011, 38(2): 177-184 |
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| 作者姓名： | 冯伟兴 王科俊 贺波 李 霞 |
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| 作者单位： | 哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院，哈尔滨 150081；哈尔滨工程大学自动化学院，哈尔滨 150001;哈尔滨工程大学自动化学院，哈尔滨 150001;哈尔滨工程大学自动化学院，哈尔滨 150001;哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院，哈尔滨 150081 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(61071174), 国家博士后科学基金(20100471090)和中央高校基本科研业务费专项资金(HEUCF100411)资助项目 |
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| 摘 要： | 基因启动子甲基化对转录因子结合的抑制作用是一种有效的基因转录调控机制.尽管基因启动子甲基化水平已经可以通过实验测量,但仍未有有效的方法利用这些数据定量分析甲基化对转录因子结合的影响.设计一个通用模型来描述基因启动子甲基化对转录因子结合的抑制作用.在特定细胞环境下,通过基因表达与转录因子在基因启动子上结合值之间的相关性分析,实现模型参数求取,并基于该模型进行甲基化对转录因子结合的抑制作用分析.神经细胞生物实验数据测试证明了该方法的有效性.
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| 关 键 词： | 基因启动子 转录因子 DNA甲基化 分析方法 |
| 收稿时间： | 2010-07-05 |
| 修稿时间： | 2010-11-17 |
Method to Analyze Gene Promoter Methylation Inhibition Effect on Binding of Transcription Factors |
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| FENG Wei-Xing,WANG Ke-Jun,HE Bo and LI Xia. Method to Analyze Gene Promoter Methylation Inhibition Effect on Binding of Transcription Factors[J]. Progress In Biochemistry and Biophysics, 2011, 38(2): 177-184 |
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| Authors: | FENG Wei-Xing WANG Ke-Jun HE Bo LI Xia |
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| Affiliation: | College of Bioinformatics Science and Technology, Harbin Medical University, Harbin 150081, China;Automation College, Harbin Engineering University, Harbin 150001, China;Automation College, Harbin Engineering University, Harbin 150001, China;Automation College, Harbin Engineering University, Harbin 150001, China;College of Bioinformatics Science and Technology, Harbin Medical University, Harbin 150081, China |
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