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云锦杜鹃NRT基因序列的生物信息学分析
引用本文:魏翔莺,张春英,付海辉,潘东明.云锦杜鹃NRT基因序列的生物信息学分析[J].广西植物,2014(2):242-247.
作者姓名:魏翔莺  张春英  付海辉  潘东明
作者单位:1. 福建农林大学 园艺学院,福州 350002; 上海市园林科学研究所,上海 200232
2. 上海市园林科学研究所,上海,200232
3. 厦门大学 环境与生态学院,厦门,361101
4. 福建农林大学 园艺学院,福州,350002
基金项目:国家自然科学基金(30972409)
摘    要:通过转录组测序,获得在接种 ERM 真菌的云锦杜鹃苗根系中显著差异表达的基因,其中硝酸根转运蛋白(NRT )基因是硝态氮吸收转运的关键基因。利用生物信息学方法,分析云锦杜鹃根转录组的硝酸根转运蛋白(NRT )基因序列,对其推导的氨基酸的理化性质、亲水性/疏水性、跨膜结构、导肽、二级结构、高级结构进行预测,并对硝酸根转运蛋白的氨基酸做进化发育分析。为进一步了解 NRT 基因在云锦杜鹃接种苗根系氮素吸收的作用奠定了基础。

关 键 词:云锦杜鹃  硝酸根转运蛋白  生物信息学  进化树

Bioinformatics analysis of NRT gene sequences in Rhododendron fortunei
WEI Xiang-Ying,ZHANG Chun-Ying,FU Hai-Hui,PAN Dong-Ming.Bioinformatics analysis of NRT gene sequences in Rhododendron fortunei[J].Guihaia,2014(2):242-247.
Authors:WEI Xiang-Ying  ZHANG Chun-Ying  FU Hai-Hui  PAN Dong-Ming
Institution:1. College of Horticulture, Fujian Agriculture and Forestry University, Fuzhou 350002, China; 2. Shanghai Landscape and Gardening Research Institute, Shanghai 200232, China; 3. College of Environment and Ecology, Xiamen University, Xiamen 361101, China
Abstract:
Keywords:Rhododendron fortunei  NRT  bioinformatics  phylogenetic tree
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