| 拟南芥和琴叶拟南芥中MADS-box基因的比较进化分析 |
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| 引用本文： | 薛皓月,徐桂霞,国春策,山红艳,孔宏智.拟南芥和琴叶拟南芥中MADS-box基因的比较进化分析[J].生物多样性,2010,18(2). |
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| 作者姓名： | 薛皓月 徐桂霞 国春策 山红艳 孔宏智 |
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| 作者单位： | 1. 中国科学院植物研究所系统与进化植物学国家重点实验室,北京;100093中国科学院研究生院,北京100049
2. 中国科学院植物研究所系统与进化植物学国家重点实验室,北京,100093 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金重点项目(30530090); 国家自然科学基金面上项目(30970210) |
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| 摘 要： | MADS-box基因编码一类转录因子。在被子植物中,MADS-box基因对于营养生长和生殖发育都有重要的调控作用,是植物体(特别是花序、花和果实)的正常发育所不可或缺的。为了理解近缘物种在遗传基础上的异同,我们对拟南芥(Arabidopsis thaliana)和琴叶拟南芥(A.lyrata)基因组中MADS-box基因的拷贝数目和进化式样进行了比较分析。通过搜索公共数据库,我们在拟南芥和琴叶拟南芥中分别鉴定出了106和115个基因。系统发育分析的结果表明,这些基因属于I型和II型MADS-box基因。在两个物种分化之后,II型基因的拷贝数目变化不大,I型基因则经历了多次独立的基因丢失和获得事件。通过比较这些基因在染色体上的排列,我们不但鉴定出了存在微共线性的基因组区段,而且发现新基因产生的主要机制是串联重复和散在重复。分子进化的研究进一步表明,I型和II型基因在进化式样上存在着显著差异:II型基因在进化中一般都受到了较强的选择压力,而I型基因大多受到的选择压力较弱。本研究将为深入理解近缘物种在基因和基因组层面上的异同、探讨物种分化和生物多样性形成的机制等问题提供新思路。
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| 关 键 词： | Arabidopsisthaliana A.lyrata MADS-box基因 拷贝数变化 进化速率 |
Comparative evolutionary analysis of MADS-box genes in Arabidopsisthaliana and A.lyrata |
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| Haoyue Xue,Guixia Xu,Chunce Guo,Hongyan Shan,Hongzhi Kong.Comparative evolutionary analysis of MADS-box genes in Arabidopsisthaliana and A.lyrata[J].Biodiversity Science,2010,18(2). |
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| Authors: | Haoyue Xue Guixia Xu Chunce Guo Hongyan Shan Hongzhi Kong |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Arabidopsis thaliana A lyrata MADS-box gene copy number variation evolutionary rate |
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