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光萼荷属植物SSR反应体系确立与指纹图谱构建
引用本文:张飞,王炜勇,张智,田丹青,刘建新,刘晓静.光萼荷属植物SSR反应体系确立与指纹图谱构建[J].植物研究,2012,32(1):115-119.
作者姓名:张飞  王炜勇  张智  田丹青  刘建新  刘晓静
作者单位:浙江省农业科学院花卉研究开发中心
基金项目:国家自然科学基金(31101570);浙江省自然科学基金(Y3110271);浙江省重大科技专项(2009C12095);浙江省农业公益性技术应用研究计划(2000C22014);浙江省重点科技创新团队项目(2011R50034);杭州市种子种苗专项(20110332H15);浙江省农科院创新能力提升工程(2011R25Y01D01)
摘    要:利用正交试验设计优化并确立光萼荷属(Aechmea)植物SSR反应体系,构建部分光萼荷属植物的SSR分子指纹图谱。结果表明:光萼荷属植物的最佳SSR反应体系为10 μL总体积包括1×PCR buffer、Mg2+ 2.0 mmol·L-1dNTPs 200 μmol·L-1、引物2.5 μmol·L-1、模板DNA 90 ng和Taq DNA聚合酶1.5 U。利用该体系和6对SSR引物对15份光萼荷属植物进行扩增反应和电泳检测,其中M1、M3、M4等3对SSR引物扩增图谱清晰、多态性较高,均能将该15份光萼荷属植物鉴别出来,初步建立了15份光萼荷属植物的SSR分子指纹图谱,进一步证明该SSR反应体系稳定可靠,可以有效用于光萼荷属植物种质资源鉴定。

关 键 词:光萼荷属  SSR  正交实验设计  反应体系优化  指纹图谱

Establishment of SSR Reaction System and Fingerprinting for Some Aechmea Species
ZHANG Fei,WANG Wei-Yong ZHANG Zhi,TIAN Dan-Qing LIU Jian-Xin LIU Xiao-Jing.Establishment of SSR Reaction System and Fingerprinting for Some Aechmea Species[J].Bulletin of Botanical Research,2012,32(1):115-119.
Authors:ZHANG Fei  WANG Wei-Yong ZHANG Zhi  TIAN Dan-Qing LIU Jian-Xin LIU Xiao-Jing
Institution:(Flower Research & Development Centre,Zhejiang Academy of Agricultural Sciences,Hangzhou 311202)
Abstract:The SSR reaction system was established by orthogonal design and the SSR fingerprints were constructed for some ornamental bromeliads in Aechmea in this study.The results showed that the optimal SSR reaction system of Aechmea was a total of 10μL containing 1×PCR buffer,Mg2+ 2.0mmol·L-1,dNTPs 200μmol·L-1,primers 2.5μmol·L-1,template DNA 90ng and Taq DNA polymerase 1.5U.Three informative and polymorphic SSR primers,namely M1,M3 and M4,were screened out from 6 SSR primers based on the established SSR reaction system.Three molecular fingerprints were preliminarily constructed for 15 samples of Aechmea species by these three SSR primers,respectively.The establishment of SSR fingerprint proved the SSR reaction system was stable and reliable,and could be further used in germplasm identification of Aechmea.
Keywords:Aechmea  SSR  orthogonal experiment design  optimization of reaction system  fingerprint
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