山东省柯萨奇病毒B1型VP1区全基因序列分析 |
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引用本文: | 王海岩,陶泽新,李岩,张文强,刘晓林,徐爱强.山东省柯萨奇病毒B1型VP1区全基因序列分析[J].病毒学报,2016,32(6). |
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作者姓名: | 王海岩 陶泽新 李岩 张文强 刘晓林 徐爱强 |
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作者单位: | 山东大学公共卫生学院 济南250014;山东省疾病预防控制中心山东大学预防医学研究院山东省传染病预防控制重点实验室,济南250014;山东省疾病预防控制中心山东大学预防医学研究院山东省传染病预防控制重点实验室,济南,250014 |
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基金项目: | 泰山学者工程专项经费资助项目;山东省自然科学基金;国家自然科学基金 |
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摘 要: | 为了解柯萨奇病毒B1型(Coxsackievirus B1,CV-B1)山东地方株的分子流行病学特征,本研究对1994年至2015年山东省急性弛缓性麻痹(Acute flaccid paralysis,AFP)监测系统、环境污水监测和无菌性脑膜炎病例标本中分离到的CV-B1病毒进行了VP1序列测定、系统发生学分析和同源性分析。共分离到CV-B1病毒53株,其中AFP监测、污水和及脑炎标本各分离到41株、4株和8株。基于VP1完整编码区序列的系统发生学分析显示CVB1山东株与国内其他分离株属于一个大的分支,该分支内无国外分离株,国外分离株构成了其他两个分支。山东株之间的VP1核苷酸同源性为84.4%~100.0%,与其他国家分离株的同源性为77.9%~85.0%。研究结果表明,中国CV-B1分离株与国外株相比有较大的遗传差异,需要加强相关手足口病病毒学监测,关注不同传播链的新的基因亚型的肠道病毒的输入。
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关 键 词: | 手足口病 柯萨奇病毒B1型 系统发生 肠道病毒 同源性 |
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