一株与儿童腹泻相关的跨多种属的基因重配G3P[3]型轮状病毒 |
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引用本文: | 董慧瑾,钱渊,农艺,张又,莫兆军,李荣成.一株与儿童腹泻相关的跨多种属的基因重配G3P[3]型轮状病毒[J].病毒学报,2016,32(2). |
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作者姓名: | 董慧瑾 钱渊 农艺 张又 莫兆军 李荣成 |
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作者单位: | 首都儿科研究所病毒研究室,儿童病毒病病原学北京市重点实验室,北京100020;广西壮族自治区疾病预防控制中心,广西南宁,530028 |
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基金项目: | 北京市科委项目;北京市自然科学基金 |
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摘 要: | G3P3]型别多见于猫/狗A组轮状病毒(Group A rotavirus,RVA)。本研究前期工作中从广西农村一名腹泻儿童粪便标本中检测到1例在人的感染中少见的G3P3]型RVA(命名M2-102),但经初步基因分析提示其VP7和VP4基因均同猫/狗G3P3]RVAs进化距离远。为了解M2-102的种属来源,本研究对其全基因组11条基因进行了RT-PCR扩增、测序和序列分析。使用RotaC分型工具对所获得的M2-102全基因组基因序列进行分型。结果显示RVA/Human-wt/CHN/M2-102/2014/G3P3]具有G3-P3]-I3-R3-C3-M3-A9-N3-T3-E3-H6基因组型。序列分析进一步显示M2-102基因组中有5条基因(VP7、VP1、VP2、NSP2和NSP3)同云南蝙蝠MYAS33株亲缘关系近,处于相同的进化树支;另有5条基因(VP4、VP3、NSP1、NSP4和NSP5)同猿猴RRV株进化距离近,位于相同的进化树支;仅有1条基因VP6同人AU-1样RVAs处在相同进化树支,并具有较高核苷酸同源性。推测M2-102是一例由人AU-1样病毒同蝙蝠株MYAS33及猿猴株RRV类似病毒经基因重配而产生的多种属来源的重配毒株。
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关 键 词: | 人轮状病毒 G3P[3] 基因组 基因重配 |
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