| 不结球白菜Ty1-copia类逆转座子序列的克隆及表达 |
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| 引用本文： | 肖栋,侯喜林,马景蕃,王枫,齐莉,李音孜. 不结球白菜Ty1-copia类逆转座子序列的克隆及表达[J]. 西北植物学报, 2009, 29(4) |
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| 作者姓名： | 肖栋 侯喜林 马景蕃 王枫 齐莉 李音孜 |
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| 作者单位： | 南京农业大学,作物遗传与种质创新国家重点实验室,农业部南方蔬菜遗传改良重点开放实验室,南京,210095 |
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| 基金项目： | 江苏省自然科学基金创新学者攀登项目 |
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| 摘 要： | 参照Ty1-copia类逆转座子逆转录酶的保守区设计简并引物,分别从10个不结球白菜(Brassica campestris ssp.chinensis)品种的全基因组中均扩增出260 bp左右的目标条带. 将目的条带回收、克隆和测序后进行分析,DNAstar分析发现,这些序列存在高度的异质性,28个核苷酸序列变化范围为224～278 bp,同源性范围为16.7%～83.0%.28条序列通过核苷酸聚类分为8个家族.推导氨基酸序列有移框突变、终止子突变或二者兼有;与已登录的不同物种同一类型逆转录酶氨基酸系统进化树分析表明,不结球白菜Ty1-copia类逆转座子与芥菜型油菜、拟南芥、芜菁、甜菜可能有共同的起源.半定量和实时定量PCR检测表明,水杨酸(salicylic acid)和Peronospora parasitica均能激活不结球白菜Ty1-copia类逆转座子,逆转座子在不结球白菜叶片中的表达特征说明它可能参与寄主对病原菌的抗性.
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| 关 键 词： | 不结球白菜 Ty1-copia类逆转座子 逆转录酶 异质性 活性分析 |
Cloning and Expression Analysis of Ty1-copia-like Retrotransposons in Brassica campestris ssp.chinensis |
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| XIAO Dong,HOU Xi-lin,MA Jing-fan,WANG Feng,QI Li,LI Yin-zi. Cloning and Expression Analysis of Ty1-copia-like Retrotransposons in Brassica campestris ssp.chinensis[J]. Acta Botanica Boreali-Occidentalia Sinica, 2009, 29(4) |
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| Authors: | XIAO Dong HOU Xi-lin MA Jing-fan WANG Feng QI Li LI Yin-zi |
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