| 罗氏沼虾急性低温应激响应的转录组分析 |
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| 引用本文： | 杨旻珉,屠海慧,邢钱钱,唐琼英,易少奎,夏正龙,蔡缪荧,陈国柱,蓝璇,钟镇霄,黄笑,高权新,杨国梁.罗氏沼虾急性低温应激响应的转录组分析[J].水生生物学报,2023,47(4):581-593. |
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| 作者姓名： | 杨旻珉 屠海慧 邢钱钱 唐琼英 易少奎 夏正龙 蔡缪荧 陈国柱 蓝璇 钟镇霄 黄笑 高权新 杨国梁 |
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| 作者单位： | 1.湖州师范学院313000;2.江苏数丰水产种业有限公司225654; |
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| 基金项目： | 江苏省科技厅重点研发专项资金(现代农业)项目(BE2019352)；国家重点研发计划“蓝色粮仓科技创新”重点专项(2018YFD0901300)；国家现代农业产业技术体系资助项目(CARS-48)；浙江省农业(水产)新品种选育重大科技专项(2021C02069-4-3)资助。 |
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| 摘 要： | 为探究罗氏沼虾(Macrobrachium rosenbergii)急性低温应激响应的基因表达模式,研究以罗氏沼虾成虾为研究对象,分别设置实验组(16℃)和对照组(24℃),实验组从24℃急性降温(2℃/1h)至16℃后的0、1h、3h、6h、12h、24h和回温至24℃后共7个时间点采集肝胰腺组织进行转录组测序分析。差异表达基因(DEGs)筛选结果显示,胁迫3h与回温后的DEGs数量(5062个)几乎是1h与回温后的1.5倍(3516个),随着胁迫时间的延长,各时间点与回温后的DEGs数量逐渐降低。KEGG富集发现, DEGs显著富集在溶酶体、淀粉和蔗糖代谢、抗原加工与呈递等途径中。此外,罗氏沼虾在急性低温应激下,黏着斑、ECM-受体互作、细胞色素P450对异生物质的代谢、谷胱甘肽代谢、氧化磷酸化、p53信号通路等相关基因也发生了显著变化。WGCNA分析发现各组间的共有DEGs聚类在与细胞功能及免疫相关模块和与能量物质代谢相关模块上。另外,花生四烯酸代谢信号通路中的Cytochrome P450 2L1-like基因、谷胱甘肽代谢信号通路中的NADP-specific isocitr...
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| 关 键 词： | 急性低温应激 肝胰腺 转录组 差异表达基因 能量代谢 免疫调节 罗氏沼虾 |
| 收稿时间： | 2022-01-24 |
TRANSCTIPTOMIC RESPONSES TO ACUTE LOW TEMPERATURE STRESS IN GIANT FRESHWATER PRAWN MACROBRACHIUM ROSENBERGII |
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