| 黄秆乌哺鸡竹转录组EST-SSR分子标记开发与应用 |
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| 引用本文： | 娄永峰,甘然,朱成磊,肖复明,高志民.黄秆乌哺鸡竹转录组EST-SSR分子标记开发与应用[J].植物科学学报,2022,40(3):355-364. |
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| 作者姓名： | 娄永峰 甘然 朱成磊 肖复明 高志民 |
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| 作者单位： | 1. 江西省林业科学院, 江西省植物生物技术重点实验室, 南昌 330032;
2. 国际竹藤中心, 国家林业和草原局/北京市竹藤科学与技术重点开放实验室, 北京 100102 |
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| 基金项目： | 国家林木种质资源共享服务平台(2005DKA21003)；国际竹藤中心基本科研业务费专项(1632020004)。 |
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| 摘 要： | 基于黄秆乌哺鸡竹(Phyllostachys vivax McClure f. aureocaulis N. X. Ma)转录组数据，利用生物信息学方法分析其SSR位点分布特征，同时针对“黄秆”和“绿秆”两种类型差异表达基因序列中的SSR位点设计引物，并利用刚竹属(Phyllostachys)材料验证其通用性。结果显示，从黄秆乌哺鸡竹89 874个Unigenes序列中，共鉴定出12 651个SSR位点，分布频率为14.07%；其中单核苷酸重复基序最多(51.02%)、其次为3核苷酸(25.61%)和2核苷酸(21.94%)；共发现80种重复基序，其中出现频率最高的为A/T(46.60%)，其次是AG/CT(13.97%)和CCG/CGG(9.90%)。在设计的51对引物中，44对(86.27%)能有效扩增，在刚竹属材料中平均通用性为92.41%，其中39对具有多态性，多态性EST-SSR标记能区分同属的不同种，但不能有效区分种内种质资源。
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| 关 键 词： | 黄秆乌哺鸡竹 转录组 EST-SSR标记 通用性 |
| 收稿时间： | 2021-11-09 |
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