| 基于RAPD标记的5个南京椴居群遗传多样性分析 |
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| 引用本文： | 汤诗杰,郑玉红,汤庚国. 基于RAPD标记的5个南京椴居群遗传多样性分析[J]. 植物资源与环境学报, 2013, 22(3) |
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| 作者姓名： | 汤诗杰 郑玉红 汤庚国 |
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| 作者单位： | 1. 江苏省·中国科学院植物研究所(南京中山植物园),江苏南京210014
2. 南京林业大学森林资源与环境学院,江苏南京,210037 |
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| 基金项目： | 江苏省林业三新工程项目，江苏省科技支撑计划项目 |
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| 摘 要： | 采用RAPD标记技术,对分布于江苏省(紫金山、牛首山和宝华山)及安徽省(皇藏峪和琅琊山)的5个南京椴(Tilia miqueliana Maxim.)居群的遗传多样性进行了分析,并采用UPGMA聚类方法研究了5个居群的遗传关系.结果表明:使用10条多态性引物从5个居群的总DNA中扩增出169条带,其中多态性条带151条,多态性条带百分率达89.34％.各居群的多态性条带百分率(PPB)、有效等位基因数(Ⅳe)、Nei's基因多样度(h)和Shannon's多样性指数(I)均有明显差异,其中,宝华山居群的各项指标均最高,紫金山和牛首山居群的PPB值最低,琅琊山居群的Ne值最低,紫金山居群的h和I值均最低.5个居群的I、h和Ⅳe值分别为0.2430～ 0.335 1、0.1544 ～0.218 2和1.248 9～1.362 7;在种水平上的I、h和Ne值分别为0.359 4、0.223 6和1.352 9.居群内变异占总变异的75.95％,居群间变异占总变异的24.05％.居群内和居群间的基因多样度分别为0.218 5和0.173 2,物种水平上的基因分化系数为0.207 5,居群间的基因流为1.909 3.各居群间的遗传距离差异较大;其中,皇藏峪与牛首山居群的遗传距离最近,仅为0.026 5;宝华山与紫金山居群的遗传距离最远,为0.134 4.通过聚类分析可将5个南京椴居群分为3支,宝华山和琅琊山居群各自独立为2支,皇藏峪、紫金山和牛首山居群聚为1支,且可进一步分为2个亚支,皇藏峪居群为1个亚支、紫金山和牛首山居群聚为1个亚支.研究结果表明:南京椴居群内的遗传多样性较高,但居群内的变异占主导地位,居群间存在明显的遗传分化.
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| 关 键 词： | 南京椴 RAPD标记 居群变异 遗传多样性 基因分化 聚类分析 |
Genetic diversity analysis on five populations of Tilia miqueliana based on RAPD marker |
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| TANG Shijie , ZHENG Yuhong , TANG Gengguo. Genetic diversity analysis on five populations of Tilia miqueliana based on RAPD marker[J]. Journal of Plant Resources and Environment, 2013, 22(3) |
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| Authors: | TANG Shijie ZHENG Yuhong TANG Gengguo |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Tilia miqueliana Maxim. RAPD marker population variation genetic diversity gene differentiation cluster analysis |
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