| 研究报告：鳗弧菌（Vibrio anguillarum）核酸适配体的筛选及其结合蛋白的分离鉴定 |
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| 引用本文： | 郑江,刘慧敏,黄力行,林筱钧,彭雪云,江兴龙,周建传,汤学敏. 研究报告：鳗弧菌（Vibrio anguillarum）核酸适配体的筛选及其结合蛋白的分离鉴定[J]. 生物化学与生物物理进展, 2022, 49(1): 250-261 |
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| 作者姓名： | 郑江 刘慧敏 黄力行 林筱钧 彭雪云 江兴龙 周建传 汤学敏 |
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| 作者单位： | 1）集美大学水产学院，鳗鲡现代产业技术教育部工程研究中心，福建省水产生物育种与健康养殖工程研究中心，厦门 361021;2）福建省特种水产配合饲料重点实验室，福清 350308,1）集美大学水产学院，鳗鲡现代产业技术教育部工程研究中心，福建省水产生物育种与健康养殖工程研究中心，厦门 361021,1）集美大学水产学院，鳗鲡现代产业技术教育部工程研究中心，福建省水产生物育种与健康养殖工程研究中心，厦门 361021,1）集美大学水产学院，鳗鲡现代产业技术教育部工程研究中心，福建省水产生物育种与健康养殖工程研究中心，厦门 361021,1）集美大学水产学院，鳗鲡现代产业技术教育部工程研究中心，福建省水产生物育种与健康养殖工程研究中心，厦门 361021,1）集美大学水产学院，鳗鲡现代产业技术教育部工程研究中心，福建省水产生物育种与健康养殖工程研究中心，厦门 361021,1）集美大学水产学院，鳗鲡现代产业技术教育部工程研究中心，福建省水产生物育种与健康养殖工程研究中心，厦门 361021,1）集美大学水产学院，鳗鲡现代产业技术教育部工程研究中心，福建省水产生物育种与健康养殖工程研究中心，厦门 361021 |
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| 基金项目： | 福建省自然科学基金（2021J01823，2018J01455），鳗鲡现代产业技术教育部工程研究中心开放基金（RE202104，RE201808），福建省水产生物育种与健康养殖工程研究中心开放基金（DF201901）和福建省特种水产配合饲料重点实验室开放课题（TMKJZ1909）资助项目。 |
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| 摘 要： | 目的鳗弧菌（Vibrio anguillarum）是水产养殖中的重要条件致病菌,每年给水产养殖业造成巨大的经济损失,研究其致病机制、对其进行快速的检测鉴定是其病害防治的前提和基础。核酸适配体因其高亲和力、高特异性等多种优点,在微生物的靶标分析、检测鉴定以及致病机制等多个领域都呈现出较好的应用潜力。因此,筛选鳗弧菌的核酸适配体,利用核酸适配体对鳗弧菌相关位点进行分析鉴定,不仅能为鳗弧菌的检测鉴定提供一个新的手段,对于探索鳗弧菌相关位点在其病害防治中的作用也具有重要意义。方法以鳗弧菌为靶目标,采用每轮测序的SELEX筛选方法,从高频序列中筛选鳗弧菌的核酸适配体;采用单链DNA浓度法测定核酸适配体的亲和力,研究核酸适配体对鳗弧菌的亲和特异性;采用Origin软件、选择反比例函数（Hyperbola函数）进行非线性拟合,获得核酸适配体的亲和常数（Kd）和最大亲和力（Am）;采用磁分离技术和聚丙烯酰胺凝胶电泳分离纯化出核酸适配体H5的结合蛋白,通过质谱对该蛋白质进行分析鉴定,并利用Prabi、Phyre2、Psortb 3.0等在线网站分析该结合蛋白的...
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| 关 键 词： | 核酸适配体 鳗弧菌 高频序列 亲和常数 最大亲和力 结合蛋白 SELEX 丙酮酸脱氢酶 |
| 收稿时间： | 2021-10-02 |
| 修稿时间： | 2021-11-25 |
Research: Selection of Aptamers Against Vibrio anguillarum and Separation and Identification of Aptamer Binding Protein |
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| ZHENG Jiang,LIU Hui-Min,HUANG Li-Xing,LIN Xiao-Jun,PENG Xue-Yun,JIANG Xing-Long,ZHOU Jian-Chuan and TANG Xue-Min. Research: Selection of Aptamers Against Vibrio anguillarum and Separation and Identification of Aptamer Binding Protein[J]. Progress In Biochemistry and Biophysics, 2022, 49(1): 250-261 |
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| Authors: | ZHENG Jiang LIU Hui-Min HUANG Li-Xing LIN Xiao-Jun PENG Xue-Yun JIANG Xing-Long ZHOU Jian-Chuan TANG Xue-Min |
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| Affiliation: | 1)Fisheries College of Jimei University, Engineering Research Center of Modern Technology for Eel Industry, Ministry of Education, Engineering Research Center of Aquaculture Breeding and Healthy of Fujian, Xiamen 361021, China;2)Fujian Province Key Laboratory of Special Aquatic Formula Feed, Fuqing 350308, China,1)Fisheries College of Jimei University, Engineering Research Center of Modern Technology for Eel Industry, Ministry of Education, Engineering Research Center of Aquaculture Breeding and Healthy of Fujian, Xiamen 361021, China,1)Fisheries College of Jimei University, Engineering Research Center of Modern Technology for Eel Industry, Ministry of Education, Engineering Research Center of Aquaculture Breeding and Healthy of Fujian, Xiamen 361021, China,1)Fisheries College of Jimei University, Engineering Research Center of Modern Technology for Eel Industry, Ministry of Education, Engineering Research Center of Aquaculture Breeding and Healthy of Fujian, Xiamen 361021, China,1)Fisheries College of Jimei University, Engineering Research Center of Modern Technology for Eel Industry, Ministry of Education, Engineering Research Center of Aquaculture Breeding and Healthy of Fujian, Xiamen 361021, China,1)Fisheries College of Jimei University, Engineering Research Center of Modern Technology for Eel Industry, Ministry of Education, Engineering Research Center of Aquaculture Breeding and Healthy of Fujian, Xiamen 361021, China,1)Fisheries College of Jimei University, Engineering Research Center of Modern Technology for Eel Industry, Ministry of Education, Engineering Research Center of Aquaculture Breeding and Healthy of Fujian, Xiamen 361021, China,1)Fisheries College of Jimei University, Engineering Research Center of Modern Technology for Eel Industry, Ministry of Education, Engineering Research Center of Aquaculture Breeding and Healthy of Fujian, Xiamen 361021, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | aptamer Vibrio anguillarum sequences with high frequency affinity constant maximum affinity binding protein SELEX pyruvate dehydrogenase |
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