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基于荧光SSR标记的玉米自交系遗传结构解析
引用本文:张全芳,梁水美,李燕,刘艳艳,范阳阳,郭庆法,鲁守平,步迅. 基于荧光SSR标记的玉米自交系遗传结构解析[J]. 植物遗传资源学报, 2017, 18(1): 19-31
作者姓名:张全芳  梁水美  李燕  刘艳艳  范阳阳  郭庆法  鲁守平  步迅
作者单位:山东省农业科学院,山东省农业科学院生物技术研究中心,山东省农业科学院,山东省农业科学院,山东省农业科学院,山东省农业科学院,山东省农业科学院,山东省农业科学院
基金项目:本研究由国家玉米产业体系-现代玉米产业技术体系建设(CARS-02-06),2014山东省农业良种工程项目-玉米种质重要农艺性状评价、分子标记及优异种质创新,公益性行业(农业)科研专项经费项目-主要农作物高活力种子生产关键技术研究与示范(201303002)资助
摘    要:利用多重SSR-PCR荧光标记检测技术,对本单位自育和引进的259份玉米自交系进行遗传多样性和亲缘关系分析,并以11个归属于不同杂种优势群的代表自交系为参照进行群体结构分析。结果显示,50对SSR引物共检测到214个等位基因变异,基因多态性指数的平均值为0.50,每个SSR标记的多态性信息量(PIC)平均值为0.44。用UPGMA方法将270份自交系划分成3大类群,进一步进行数值化杂种优势群分析,以明确所用种质资源的杂优类群利用方向,为玉米自交系的有效利用和品种的选育提供依据。

关 键 词:玉米自交系;分子标记;遗传多样性
收稿时间:2016-03-05
修稿时间:2016-11-07

Analysis of Genetic Diversity and Genetic Structure of Maize Germplasms using Fluorescent SSR Markers
Abstract:Using automatic DNA analyzer multiple SSR-PCR fluorescent marker detection technology, we analyzed the genetic diversity of 259 maize germplasms and 11 kind of inbred lines through core 50 standard test simple sequence repeat loci which cover whole genome. Among 50 SSRs, the total No. allele was 214 for 270 inbred lines. The average of the gene diversity and PIC was 0.50 and 0.44, respectively. The 270 assays could be divided into 3 groups by UPGMA clustering method. Furthermore, we analysis the numerical value of heterosis group, in order to make clear the application of germplasm resources. The results in this study could provide the genetic basis for improving the efficiency of hybrid breeding.
Keywords:Maize (Zea mays L.) germplasms   SSR-PCR fluorescent marker   Gene diversity
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