| 利用高通量测序技术对水稻秸秆中、低温降解菌系的比较分析 |
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| 引用本文： | 班允赫,李旭,李新宇,王秀娟,苏振成,张惠文. 利用高通量测序技术对水稻秸秆中、低温降解菌系的比较分析[J]. 微生物学杂志, 2020, 0(5): 7-17 |
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| 作者姓名： | 班允赫 李旭 李新宇 王秀娟 苏振成 张惠文 |
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| 作者单位： | 中国科学院 沈阳应用生态研究所污染生态与环境工程重点实验室，辽宁 沈阳 110164 |
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| 基金项目： | 国家重点研发计划项目（2016YFD0300904） |
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| 摘 要： | 采用Illumina MiSeq高通量测序技术，对中、低温（中温25 ℃、低温10 ℃）富集驯化所得水稻秸秆降解菌系进行测序；采用生物信息学方法对中、低温秸秆降解菌系群落生物多样性进行分析。结果表明，测序质控后获得601 489条16S rDNA序列，平均长度273 bp，经Silval 132数据库比对，中温降解菌系包括18个门，172个属，302个OTU，其中优势菌属为弓形杆菌属（Arcobacter）、拟杆菌属（Bacteroides）、屠场杆菌属（Macellibacteroides）、假单胞菌属（Pseudomonas）和梭形杆菌属（Lysinibacillus）；低温降解菌系包括16个门，169个属，280个OTU，其中优势菌属为弓形杆菌属、屠场杆菌属、拟杆菌属、丛毛单胞属（Comamonas）和假单胞菌属。温度对降解菌系中优势菌门的相对丰度无显著影响，中、低温秸秆降解菌系主要菌属相对丰度差异显著。
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| 关 键 词： | 秸秆降解菌系 低温驯化 微生物多样性 Miseq高通量测序 |
Comparative Analysis of Rice Straw-Decomposing Mesophilic and Cryogenic Microbial Consortia Using High-Throughput Sequencing Technology |
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| BAN Yun-he,LI Xu,LI Xin-yu,WANG Xiu-juan,SU Zhen-cheng,ZHANG Hui-wen. Comparative Analysis of Rice Straw-Decomposing Mesophilic and Cryogenic Microbial Consortia Using High-Throughput Sequencing Technology[J]. Journal of Microbiology, 2020, 0(5): 7-17 |
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| Authors: | BAN Yun-he LI Xu LI Xin-yu WANG Xiu-juan SU Zhen-cheng ZHANG Hui-wen |
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| Affiliation: | Key Lab. of Pollut. Ecol. & Environ. Engin., Inst. of Appl. Ecol., Chn. Acad. of Sci., Shenyang 110164 |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | straw-degrading microbial consortia cryogenic taming microbial diversity Miseq high-throughput sequencing |
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