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| 敲除trim47基因斑马鱼脑和脾的比较转录组学分析（英文） | |
| 作者姓名： | 姚健 王业大 王方 柳力月 鲁元安 刘学芹 |
| 作者单位： | 1. 华中农业大学水产学院;2. 湖北省水生动物疾病预防控制工程技术研究中心;3. 中国科学院水生生物研究所中国斑马鱼资源中心;4. 夏威夷大学马诺阿分校公共卫生科学系 |
| 基金项目： | Supported by the National Natural Science Foundation of China (31972834)；;the National Key Research and Development Program of China (2018YFD0900505)；;Fundamental Research Funds for the Central Universities (2662018YJ022)； |
| 摘 要： | 用CRISPR/Cas9技术敲除斑马鱼(Danio Rerio)的trim47,收集TRIM47-/-(trim47基因敲除)和WT(野生型)斑马鱼的大脑和脾脏进行RNA-seq分析,以鉴定差异表达基因(DEGs)。总共确定了271个DEGs,经过简要分析,将这些DEGs注释为KEGG途径和GO富集分析,与WT组相比, TRIM47-/-组的脑中DEGs集中在细胞黏附和谷氨酸能突触信号传导途径中。在脾脏中,与野生型组相比, TRIM47-/-组的DEGs在补体和凝血级联信号通路中发生了变化。使用qRT-PCR验证了脑和脾中与补体途径相关的基因,与转录组数据一致。这些结果表明, Trim47在脾脏和大脑中起着重要的生物学作用,尤其是通过补体途径参与先天免疫功能。体内感染实验表明, trim47基因敲除可提高斑马鱼中鲤春病毒血症病毒(SVCV)的感染率。总之,这些发现为TRIM成员在先天免疫中的功能提供了新线索。 |
| 关 键 词： | TRIM47 敲除 差异基因 斑马鱼 |