计算方法在蛋白-蛋白相互作用小分子调节剂研究发现中的应用

蛋白-蛋白相互作用(protein-protein interactions, PPIs)涉及各个重要的生物通路以及生理过程,作为一类新的药物靶标,近年来得到了学术界和工业界的广泛关注。经过多年的研究,人们更好地了解了PPIs界面的特点,也有小分子抑制剂成功进入临床研究乃至上市,其中计算机辅助的合理设计方法功不可没。本文综述了计算方法应用在PPIs热点残基预测、PPIs小分子调节剂的虚拟筛选策略方面的一些成功案例。但以现有的计算方法研究PPIs仍有诸多挑战。针对PPIs作用特点的计算方法以及在PPIs筛选中更多地考虑蛋白柔性将是今后研究的发展方向。