| 齿缘摄龟线粒体基因组全序列与系统进化 |
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| 引用本文： | 蒋钦杨,沈夏霜,黄钧,钟瑞鹏,郭亚芬,黄艳华,唐一波,严雪瑜. 齿缘摄龟线粒体基因组全序列与系统进化[J]. 动物学杂志, 2014, 49(4): 536-545 |
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| 作者姓名： | 蒋钦杨 沈夏霜 黄钧 钟瑞鹏 郭亚芬 黄艳华 唐一波 严雪瑜 |
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| 作者单位： | 广西大学动物科学技术学院,广西大学动物科学技术学院,广西大学动物科学技术学院,钦州市中意龟鳖养殖场,广西大学动物科学技术学院,广西大学动物科学技术学院,广西大学动物科学技术学院,广西大学动物科学技术学院 |
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| 基金项目： | 广西水产畜牧兽医局专项项目(桂渔牧财[2011]52号,桂渔牧财[2012]30号) |
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| 摘 要： | 采用常规PCR扩增并测序获得了齿缘摄龟(Cyclemys dentata)线粒体DNA(mtDNA)全序列,并研究了其基因组结构特点;根据20种龟的线粒体基因组重链蛋白编码基因序列,分别利用最大简约法(MP)、最大似然法(ML)和贝叶斯法(Bayesian)构建系统进化树,探讨这些龟鳖物种之间的系统进化关系。结果显示,齿缘摄龟线粒体基因组全序列长为16489 bp(GenBank登录号为JX455823),A+T含量为61.51%,编码37个基因,包括13个蛋白质编码基因,2个rRNA,22个tRNA和1个控制区(Dloop),基因组成与其他龟鳖类动物相似;非编码区D-loop长973 bp,包含1个中央保守区(CD),2个扩展终止结合序列区(ETASs),3个保守盒(CSBs);构建的MP树、ML树和Bayesian树的拓扑结构相似,闭壳龟属7种龟聚为一枝,拟水龟属6种龟聚为一枝,齿缘摄龟与黑桥摄龟聚在一枝,3种进化树均支持这些龟鳖物种现有的分类学地位。
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| 关 键 词： | 齿缘摄龟 线粒体全基因组 系统进化关系 |
| 收稿时间： | 2013-08-14 |
| 修稿时间： | 2014-07-09 |
The Complete Mitochondrial Genome of Cyclemys dentata and Phylogenetic Relationships among 20 Species of Turtles |
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| JIANG Qin-Yang,SHEN Xia-Shuang,HUANG Jun,ZHONG Rui-Peng,GUO Ya-Fen,HUANG Yan-Hu,TANG Yi-Bo and YAN Xue-Yu. The Complete Mitochondrial Genome of Cyclemys dentata and Phylogenetic Relationships among 20 Species of Turtles[J]. Chinese Journal of Zoology, 2014, 49(4): 536-545 |
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| Authors: | JIANG Qin-Yang SHEN Xia-Shuang HUANG Jun ZHONG Rui-Peng GUO Ya-Fen HUANG Yan-Hu TANG Yi-Bo YAN Xue-Yu |
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| Affiliation: | College of Animal Science and Technology, Guangxi University,College of Animal Science and Technology, Guangxi University,College of Animal Science and Technology, Guangxi University,Zhong-Yi turtles farm in QinZhou city,College of Animal Science and Technology, Guangxi University,College of Animal Science and Technology, Guangxi University,College of Animal Science and Technology, Guangxi University,College of Animal Science and Technology, Guangxi University |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Cyclemys dentata mitochondrial genome phylogenetic relationships. |
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