| 荔枝SRAP-PCR反应体系的优化 |
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| 引用本文： | 昝逢刚,吴转娣,曾淇,张惠云,李明芳,郑学勤. 荔枝SRAP-PCR反应体系的优化[J]. 基因组学与应用生物学, 2009, 28(1) |
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| 作者姓名： | 昝逢刚 吴转娣 曾淇 张惠云 李明芳 郑学勤 |
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| 作者单位： | 中国热带农业科学院热带生物技术研究所,海口,571101;海南大学,海口,570228;海南大学,海口,570228;中国热带农业科学院热带生物技术研究所,海口,571101 |
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| 基金项目： | 中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金资助项目 |
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| 摘 要： | SRAP(sequence-related amplified polymorphism)是基于基因的内含子和外显子区域进行检测的新型分子标记技术,具有多态性高、重复性好、易测序、便于克隆目标片段等特点,在荔枝(Litchi chinensis Sonn)中还没有相关的研究报道.为了建立适合荔枝的SRAP反应体系,对反应体系中的DNA模板、Mg2+、dNTP、引物、Taq DNA聚合酶诸因子的用量进行了探索,确立了适合荔枝的SRAP反应体系为:在20 μL反应体系中,模板DNA为40 ng,Mg2+浓度2.5 mmol/L,dNTP 0.3 mmol/L,引物5 mmol/L,Taq DNA聚合酶1.0 U.扩增程序为:94℃预变性3 min,反应前5个循环在94℃1 min、35℃1 min、72℃ 1 min的条件下运行;随后的35个循环退火温度提高到50℃;最后72℃延伸10 min.利用该反应体系对荔枝10个不同品系进行SRAP反应,用5%的变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测,结果显示:不同品系间DNA谱带多态性丰富.证实该体系稳定可靠,可以用于荔枝的分子标记研究.
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| 关 键 词： | 荔枝 SRAP-PCR反应体系 优化 |
Optimization of SRAP-PCR Reaction System in Litchi |
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| Zan Fenggang,Wu Zhuandi,Zeng Qi,Zhang Huiyun,Li Mingfang,Zheng Xueqin. Optimization of SRAP-PCR Reaction System in Litchi[J]. Genomics and Applied Biology, 2009, 28(1) |
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| Authors: | Zan Fenggang Wu Zhuandi Zeng Qi Zhang Huiyun Li Mingfang Zheng Xueqin |
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