| 猪瘟弱毒C81株全基因组测序及分子结构预测 |
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| 引用本文： | 徐卓菲 钱平 李祥敏 郭东春 姚清侠 陈焕春. 猪瘟弱毒C81株全基因组测序及分子结构预测[J]. Virologica Sinica, 2005, 20(4): 413-419 |
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| 作者姓名： | 徐卓菲 钱平 李祥敏 郭东春 姚清侠 陈焕春 |
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| 作者单位： | 华中农业大学动物医学院动物病毒室 湖北武汉430070(徐卓菲，钱平，李祥敏，郭东春，姚清侠)，华中农业大学动物医学院动物病毒室 湖北武汉430070(陈焕春) |
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| 基金项目： | 湖北省科技攻关项目(2004AA202B01)，湖北省自然科学基金(2005AB138)，中国博士后科学基金(2003034493) |
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| 摘 要： | 参照已发表的猪瘟病毒弱毒株的序列,设计7对覆盖全长基因组的引物,通过RT-PCR从感染猪瘟病毒弱毒株的PK-15细胞中扩增得到7个cDNA片段,分别克隆到pMD18-T载体并测序,利用DNASIS软件获得猪瘟病毒C81株全基因组序列(GenBank:AY663656)。C81株基因组全长12310nt,只有一个大的开放阅读框,编码3898个氨基酸的聚蛋白。序列分析表明,C81株开放阅读框与其它各毒株核苷酸和氨基酸序列的同源性变化较大,分别为84.4%~99.6%和91.6%~99.4%。同时,我们绘制了26株CSFVORF的进化树,比较了CSFV5'非翻译区核苷酸序列并推测其二级结构,发现不同毒株之间存在较大的差异,另外对C81株聚蛋白的功能域和三维结构进行了预测。
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| 关 键 词： | 猪瘟病毒 RT-PCR 序列比对 5’非翻译区 同源建模 |
| 收稿时间： | 2005-03-03 |
Complete Genome Sequencing and Molecular Structure Prediction of C81 Attenuated Strain of CSFV |
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| Xu ZhuoFei;Qian Ping;Li XiangMin;Guo DongChun;Yao QingXia;Chen HuanChun. Complete Genome Sequencing and Molecular Structure Prediction of C81 Attenuated Strain of CSFV[J]. 中国病毒学(英文版), 2005, 20(4): 413-419 |
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| Authors: | Xu ZhuoFei Qian Ping Li XiangMin Guo DongChun Yao QingXia Chen HuanChun |
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