| 利用随机多肽文库研究ZO-1中PDZ3结构域的配体结合特点 |
| |
| 作者姓名： | 郭佳岩 宋婀莉 黄海明 马素参 高友鹤 |
| |
| 作者单位： | 中国医学科学院基础医学研究所,中国协和医科大学基础医学院,蛋白质组学研究中心,医学分子生物学国家重点实验室,北京,100005 |
| |
| 基金项目： | 国家自然科学基金,国家高技术研究发展计划(863计划),国际科技合作项目,国家重点基础研究发展计划(973计划) |
| |
| 摘 要： | 建立一种研究PDZ结构域配体结合特点的简单方法 .利用酵母双杂交技术从随机多肽文库中寻找所有可能与ZO 1中PDZ3结构域结合的C末端序列 ,从现有蛋白质数据库中检索所有具有该C末端蛋白 .利用液体培养物 β 半乳糖苷酶检测实验 ,比较文库中筛选的C末端序列和已知的PDZ3结构域结合配体———JAM的C末端 (SFLV)与PDZ3结构域结合的强弱 .共筛选到 3个阳性克隆 ,其C末端序列分别为 LGWV、 LVWV和 DEWV .前 2者属于第二类PDZ结构域 ,后者属于第三类 .蛋白质数据库检索结果表明 ,有多个蛋白质具有 LGWV、 LVWV末端 ,没有检索到任何具有 DEWV末端的蛋白质 .结合强度实验结果表明 ,它们与PDZ3结构域结合强度依次为 DEWV > LGWV > LVWV > SFLV ,说明筛选的 3个C末端除了反映ZO 1中PDZ3结构域可能的潜在结合配体外 ,也有可能成为JAM蛋白阻断性试剂甚至药物的重要组成部分之一 .利用随机多肽文库 ,可以尽可能寻找所有可能与PDZ结构域结合的C末端序列 ,大大提高了基因文库筛选的效率
|
| 关 键 词： | ZO-1 PDZ3结构域 蛋白质相互作用 随机多肽文库 酵母双杂交 |
| 收稿时间： | 2004-06-20 |
| 修稿时间： | 2003-07-21 |
| 本文献已被 万方数据 等数据库收录！ |
| 点击此处可从《中国生物化学与分子生物学报》浏览原始摘要信息 |
|
点击此处可从《中国生物化学与分子生物学报》下载全文 |
|
