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胰岛素样生长因子受体Ⅰ序列结构的生物信息学分析
引用本文:麦秀英,李萍,徐柳.胰岛素样生长因子受体Ⅰ序列结构的生物信息学分析[J].生物工程学报,2016,32(5):693-701.
作者姓名:麦秀英  李萍  徐柳
作者单位:西南交通大学 生命科学与工程学院,四川 成都 610031,西南交通大学 生命科学与工程学院,四川 成都 610031,西南交通大学 生命科学与工程学院,四川 成都 610031
基金项目:教育部留学回国人员科研启动基金 (No. 2013S03008),国家自然科学基金 (No. 31500276) 资助。
摘    要:胰岛素样生长因子受体Ⅰ的3'UTR长度大于7 kb,结构复杂,有多种mi RNAs的结合位点,参与信号通路中MAPK及PI3K/AKT的调节和多种肿瘤的形成和发展,通过生物信息学分析知道其结构特点,为后续研究提供思路。分析表明儿童神经胶质瘤中IGF1R的3'UTR与mi RNAs结合位点突变率最高。分析IGF1R序列3'UTR的结构,mi RNAs结合位点,氨基酸序列的理化性质,亲疏水性,糖基化和磷酸化位点,二级结构和三级结构建模。IGF1R三级结构与配体IGF1的三级结构模拟分子对接,得到2种蛋白相互作用的氨基酸位置及名称。因此,通过对IGF1R 3'UTR突变,降低与mi RNAs的结合,IGF1R表达上调,同时改变与IGF1的氨基酸结合位点,降低2种蛋白的相互作用,从而抑制IGF1R的作用。

关 键 词:胰岛素样生长因子受体I,序列分析,三维建模,分子对接
收稿时间:2015/8/25 0:00:00

Bioinformatics analysis of sequence and structure of insulin-like growth factor-I receptor
Xiuying Mai,Ping Li and Liu Xu.Bioinformatics analysis of sequence and structure of insulin-like growth factor-I receptor[J].Chinese Journal of Biotechnology,2016,32(5):693-701.
Authors:Xiuying Mai  Ping Li and Liu Xu
Institution:School of Life Science and Engineering, Southwest Jiaotong University, Chengdu 610031, Sichuan, China,School of Life Science and Engineering, Southwest Jiaotong University, Chengdu 610031, Sichuan, China and School of Life Science and Engineering, Southwest Jiaotong University, Chengdu 610031, Sichuan, China
Abstract:
Keywords:insulin-like growth factor-I receptor (IGF1R)  sequence analysis  3D-struture modeling  molecular docking
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