| 棉花EIN3/EIL家族基因序列分析及GhEIL3基因克隆 |
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| 引用本文： | 张 析,李潇玲,郭文婷,张鹏飞,张 薇.棉花EIN3/EIL家族基因序列分析及GhEIL3基因克隆[J].西北植物学报,2017,37(3):445-452. |
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| 作者姓名： | 张 析 李潇玲 郭文婷 张鹏飞 张 薇 |
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| 作者单位： | （石河子大学 农学院，新疆石河子 832000） |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金（31260358,31560407） |
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| 摘 要： | 该研究以拟南芥AtEIN3基因为探针,从陆地棉TM-1全基因组测序数据库中筛选其同源序列,序列分析得到16条具有EIN3结构域的基因序列。对陆地棉EIN3/EIL家族基因的基因结构、系统进化、序列相似性及结构域分布情况进行分析,发现它们与拟南芥EIN3/EIL家族基因在N端具有较高相似度,其中15条基因序列包含5个保守结构,1条包含4个保守结构。在此基础上,采用RT-PCR方法从抗枯萎病的陆地棉品种‘中棉所12’中克隆得到一个新的EIN3/EIL家族基因,命名为GhEIL3(GenBank登录号为KY072936)。序列分析表明:GhEIL3基因开放阅读框长1 092bp,编码363个氨基酸,含有一个EIN3结构域。实时荧光定量PCR(qRT-PCR)结果显示,GhEIL3基因在枯萎病菌诱导后呈上调表达,诱导后1h其相对表达量达到最大值,推测GhEIL3基因可能参与棉花对枯萎病菌的防御反应。
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| 关 键 词： | 棉花 EIN3/EIL 枯萎病 基因克隆 GhEIL3 |
Sequence Analysis of EIN3/EIL Gene Family and Cloning of GhEIL3 in Cotton |
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| ZHANG Xi,LI Xiaoling,GUO Wenting,ZHANG Pengfei,ZHANG Wei.Sequence Analysis of EIN3/EIL Gene Family and Cloning of GhEIL3 in Cotton[J].Acta Botanica Boreali-Occidentalia Sinica,2017,37(3):445-452. |
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| Authors: | ZHANG Xi LI Xiaoling GUO Wenting ZHANG Pengfei ZHANG Wei |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | cotton EIN3/EILs Fusarium oxysporum f sp vasinfectum gene cloning GhEIL3 |
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