|
|||||
|
|
| 小片段DNA未知SNPs的PCR SSCP检测方法分析(英文) | |
| 引用本文： | 姜运良,李宁,胡晓湘,吴常信.小片段DNA未知SNPs的PCR SSCP检测方法分析(英文)[J].中国生物化学与分子生物学报,2002,18(6):22-26. |
| 作者姓名： | 姜运良 李宁 胡晓湘 吴常信 |
| 作者单位： | 1. 中国农业大学农业生物技术国家重点实验室,北京,100094;山东农业大学动物生物工程研究室,泰安,271018 2. 中国农业大学农业生物技术国家重点实验室,北京,100094 3. 中国农业大学动物科技学院,北京,100094 |
| 基金项目： | 国家自然科学基金重点项目 (No.3 973 0 3 60 )，国家重点基础研究发展规划项目 (No .G2 0 0 0 161)~~ |
| 摘 要： | PCR SSCP是对未知单核苷酸多态性 (SNPs)进行检测最简便、最实用的方法之一 .该方法检测的灵敏度易受片段大小的影响 .以大小在 2 0 0bp左右的PCR扩增产物为检测对象 ,对该方法的影响因素进行了分析 .结果表明 ,在 4℃条件下 ,10V cm恒压电泳 10～ 16h ,在上样缓冲液中加入10 %甘油 ,在 12 %～ 15 %的非变性聚丙烯酰胺 (arc∶bis =2 9∶1)中加入 5 %甘油可改善分辨效果 ,可作为进行小片段DNA单个碱基突变的一般检测方法 .采用该方法在猪的肌肉生长抑制素基因(MSTN)中鉴定了 3个SNPs ,在猪的雌激素受体基因 (ESR)和兔的酪氨酸酶基因中各检测到 1处SNP ,说明该方法在小片段DNA的检测上是行之有效的 ,为基因组中未知SNPs的检测提供了一种简便的方法 . |
| 关 键 词： | 小片段DNA 未知SNPs PCRSSCP检测 |
| 收稿时间： | 2002-12-20 |
Analysis of PCR-SSCP Detection for Unknown Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) in Small DNA Fragment |
|
| JIANG Yun liang ,LI Ning ,HU Xiao xiang ,WU Chang\|xin.Analysis of PCR-SSCP Detection for Unknown Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) in Small DNA Fragment[J].Chinese Journal of Biochemistry and Molecular Biology,2002,18(6):22-26. | |
| Authors: | JIANG Yun liang LI Ning HU Xiao xiang WU Chang\|xin |
| Institution: | JIANG Yun liang 1),3),LI Ning 1)*,HU Xiao xiang 1),WU Chang\|xin 2) |
| Abstract: | Single nucleotide polymorphisms(SNPs)exist widely in genomes.PCR-SSCP is one ofthe simplestand most practical approaches.The detection efficiency of PCR-SSCP for SNPs depends greatly on the size ofDNA product.In present study,a practical detection procedure for identifying unknown SNPs in DNA fragmentaround or less than 200 bp was established.By adding 5%glycerol to 12%～15%non-denaturing polyacryl-of 4℃at a constant voltage of 10 V/cm,a reasonably good result can be obtained.This method proved to beeffective when used in SNPs detection in several genes. |
| Keywords: | PCR SSCP detection SNPs Small DNA fragment |
| 本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录！ | |
| 点击此处可从《中国生物化学与分子生物学报》浏览原始摘要信息 | |
| 点击此处可从《中国生物化学与分子生物学报》下载免费的PDF全文 | |