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砂梨EST-SSR引物开发及其应用
引用本文:崔海荣,刘金义,佟兆国,王新卫,章镇,乔玉山.砂梨EST-SSR引物开发及其应用[J].西北植物学报,2010,30(8).
作者姓名:崔海荣  刘金义  佟兆国  王新卫  章镇  乔玉山
作者单位:1. 南京农业大学,园艺学院,南京,210095
2. 南京农业大学,园艺学院,南京,210095;教育部园艺作物种质创新与利用工程研究中心,南京,210095
基金项目:国家高技术研究与发展计划重点项目 
摘    要:利用GenBank和GDR数据库中的995条梨EST序列开发砂梨SSR引物,并根据开发的EST-SSR引物对砂梨'西子绿'×'喜水'F1群体的遗传变异进行分析.结果发现:(1)60个SSR位点分布于54条EST序列中,占整个EST数据库的5.4%,其中二核苷酸重复基元出现频率最高,达51.7%,其次为三核苷酸重复基元占25%.23类重复基序中AT重复基序出现的频率最高,为32.3%.(2)利用开发的25对EST-SSR引物对'西子绿'×'喜水'F1群体的遗传变异分析结果表明,其中9对引物呈现多态性,多态性引物占设计引物的36%;多态性引物扩增产物在F1群体中的等位基因数(No)平均为2,有效等位基因数(Ne)平均为1.932 4,平均杂合度观测值(Ho)和期望杂合度(He)分别为1和0.480 9.

关 键 词:砂梨  分子标记

Development and Application of EST-SSRs in Sand Pear
CUI Hai-rong,LIU Jin-yi,TONG Zhao-guo,WANG Xin-wei,ZHANG Zhen,QIAO Yu-shan.Development and Application of EST-SSRs in Sand Pear[J].Acta Botanica Boreali-Occidentalia Sinica,2010,30(8).
Authors:CUI Hai-rong  LIU Jin-yi  TONG Zhao-guo  WANG Xin-wei  ZHANG Zhen  QIAO Yu-shan
Abstract:
Keywords:EST-SSR
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