扁豆过敏原LenC3蛋白B细胞抗原表位预测及同源建模 |
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引用本文: | 郭予和,何颖,邹泽红,刘雪婷,许晨霞,陶爱林.扁豆过敏原LenC3蛋白B细胞抗原表位预测及同源建模[J].生物磁学,2014(6):1017-1021. |
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作者姓名: | 郭予和 何颖 邹泽红 刘雪婷 许晨霞 陶爱林 |
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作者单位: | 广州市过敏反应与临床免疫重点实验室/呼吸疾病国家重点实验室变态反应研究室/广州医学院第二附属医院,广东广州510260 |
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基金项目: | 国家重大科技专项重大课题(2011ZX08011-005);国家自然科学基金项目(30771240) |
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摘 要: | 目的:通过应用生物信息学软件模拟、分析预测扁豆过敏原Len c 3蛋白的结构、性质及B 细胞抗原表位, 为探索基于扁豆过敏原Len c 3 抗原表位的改造提供依据。方法:从Uniprot 蛋白质数据库中得到扁豆过敏原Len c 3的氨基酸序列,通过生物信息学软件Swiss-Model及Swiss-PdbViewer 4.0 模拟和分析扁豆过敏原Len c 3蛋白的结构,使用DNAStar软件对其B细胞抗原表位进行模拟、分析预测。结果:扁豆过敏原Len c 3蛋白为疏水性蛋白,在氨基酸残基第7-26 位有一跨膜区,Ramachandran 图评估扁豆过敏原Len c 3蛋白的三维结构显示其空间构象稳定,Len c 3蛋白潜在的B细胞抗原表位为35-36,48-50,66-71,87-90。结论:本研究通过对扁豆过敏原Len c 3蛋白进行生物信息学分析获得了该过敏原的结构、性质及潜在的B 细胞抗原表位,为进一步了解和掌握扁豆过敏原Len c 3蛋白的结构功能以及抗原性改造、单克隆抗体制备、表位疫苗设计等提供重要的线索。
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关 键 词: | 扁豆过敏原 Len C 3 结构 抗原表位 |
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