基于离散增量的支持向量机算法预测蛋白质中四类简单超二级结构 |
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引用本文: | 高苏娟.基于离散增量的支持向量机算法预测蛋白质中四类简单超二级结构[J].生物技术世界,2014(2):173-174. |
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作者姓名: | 高苏娟 |
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作者单位: | 内蒙古工业大学理学院; |
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摘 要: | 蛋白质超二级结构预测是三级结构预测的一个非常重要的中间步骤。本文从蛋白质的一级序列出发,对5793个蛋白质中的四类简单超二级结构进行预测,以位点氨基酸为参数,采用3种片段截取方式,分别用离散增量算法预测的结果不理想,将组合的离散增量值作为特征参数输入支持向量机,取得了较好的预测结果,5交叉检验的平均预测总精度达到83.0%,Matthew’s相关系数在0.71以上。
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关 键 词: | 蛋白质超二级结构 离散增量 支持向量机 |
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