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人精子特异性乳酸脱氢酶结构和功能的计算生物学分析
引用本文:汤莹,颜水堤,郑德柱,张朵,林宇翔,兰风华.人精子特异性乳酸脱氢酶结构和功能的计算生物学分析[J].中国生物化学与分子生物学报,2013,29(11):1088-1096.
作者姓名:汤莹  颜水堤  郑德柱  张朵  林宇翔  兰风华
作者单位:南京军区福州总医院全军计划生育优生优育研究所
基金项目:国家自然科学基金(No.81170562);福建省自然科学基金(No.26111058)~~
摘    要:精子特异性乳酸脱氢酶(lactate dehydrogenase,LDH),又称乳酸脱氢酶C4(lactate dehydrogenase C4,LDH-C4),特异性地存在于哺乳动物发育成熟的睾丸组织中,与精子的生成、代谢、获能等有密切关系. 根据GenBank数据库中人LDH-C4氨基酸序列(P07864),利用PROSITE数据库预测人LDH-C4的功能基序|利用Clustalw2、TreeView1.6.6进行LDH-C4进化树的构建|利用I-TASSER软件预测人LDH-C4的二、三、四级结构以及功能位点. 结果表明:在190~196位有1个LDH活性位点,该位点为脊椎动物各亚型乳酸脱氢酶共有的催化位点,为进化中的1个保守序列|从进化树来看,LDHC和LDHB的亲缘关系比较近|人LDH-C4与小鼠LDH-C4的二级、三级结构具有很高的相似性|LDH-4属乳酸脱氢酶 苹果酸脱氢酶(LDH-MDH)超家族中的LDH-(cd05293)家族的成员,属于NAD依赖性酶,拥有LDH-1家族具备的基本结构特点. 以上结果为研究LDH-C4基因突变对其功能的影响打下基础.

关 键 词:乳酸脱氢酶C4  精子特异性乳酸脱氢酶  计算生物学  
收稿时间:2013-03-18

Computational Analysis on Structure and Function of Human Sperm-specific Lactate Dehydrogenase
TANG Ying;YAN Shui-Di;ZHENG De-Zhu;ZHANG Duo;LIN Yu-Xiang;LAN Feng-Hua.Computational Analysis on Structure and Function of Human Sperm-specific Lactate Dehydrogenase[J].Chinese Journal of Biochemistry and Molecular Biology,2013,29(11):1088-1096.
Authors:TANG Ying;YAN Shui-Di;ZHENG De-Zhu;ZHANG Duo;LIN Yu-Xiang;LAN Feng-Hua
Institution:TANG Ying;YAN Shui-Di;ZHENG De-Zhu;ZHANG Duo;LIN Yu-Xiang;LAN Feng-Hua;PLA Institute of Technology for Birth Control,Fetal Health and Child Growth,Fuzhou General Hospital;
Abstract:
Keywords:
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