| 高通量 16S rRNA 标签测序法比较人与不同动物肠道微生物组多样性 |
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| 引用本文： | 邓冠华,查龙应,张国霞,王玉,黎耀涛,彭欣,周宏伟,刘移民.高通量 16S rRNA 标签测序法比较人与不同动物肠道微生物组多样性[J].生态科学,2014,33(5):851-857. |
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| 作者姓名： | 邓冠华 查龙应 张国霞 王玉 黎耀涛 彭欣 周宏伟 刘移民 |
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| 作者单位： | 1. 广州市职业病防治院职业卫生评价检测中心, 广州市医学重点学科职业健康监护科, 广州市职业环境与健康效应实验室,广州5106202. 南方医科大学公共卫生与热带医学学院, 广州5105153. 内蒙古自治区赤峰市疾病预防控制中心, 内蒙古赤峰 024000 |
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| 摘 要： | 收集人、大猪、小猪、大鼠、小鼠以及鸡五个不同个体的粪便样品 , 每个个体取两个平行样 , 提取总 DNA;PCR 扩增 , 获得 16S rRNA V6 标签片段 ; Illumina 测序 ; 经 BIPES 以及 QIIME 分析并比较菌群结构及多样性。研究结果发现 , 不同物种之间肠道菌群差异较大。五类物种肠道菌群均以厚壁菌门、拟杆菌门、以及变形菌门为主 , 但鸡的厚壁菌门显著减少 , 而变形菌门显著增加。从α多样性角度来看 , 猪肠道菌群种属丰富度及 Shannon 指数均显著高于人及鸡肠道菌群。从β多样性角度 , 尽管不同人之间的肠道菌群相似度较低 , 但不同物种之间相比较 , 小猪与大鼠肠道菌群与人相似性高于小鼠和鸡肠道菌群。与人类相比 , 小猪的肠道微生物组最相近 , 而鸡的肠道菌群相似度最低。
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