| 蛋白质水解酶和样品预处理优化技术在蛋白质组学研究中的应用 |
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| 引用本文： | 吴飞林,赵明治,张瑶,熊智,徐平.蛋白质水解酶和样品预处理优化技术在蛋白质组学研究中的应用[J].生物工程学报,2016,32(3):306-316. |
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| 作者姓名： | 吴飞林 赵明治 张瑶 熊智 徐平 |
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| 作者单位： | 1 西南林业大学 生命科学学院，云南 昆明 650224；2 军事医学科学院放射与辐射医学研究所 蛋白质组学国家重点实验室 国家蛋白质科学中心 (北京) 北京蛋白质组研究中心 蛋白质药物国家工程研究中心，北京 102206,2 军事医学科学院放射与辐射医学研究所 蛋白质组学国家重点实验室 国家蛋白质科学中心 (北京) 北京蛋白质组研究中心 蛋白质药物国家工程研究中心，北京 102206,2 军事医学科学院放射与辐射医学研究所 蛋白质组学国家重点实验室 国家蛋白质科学中心 (北京) 北京蛋白质组研究中心 蛋白质药物国家工程研究中心，北京 102206；3 中国科学院微生物研究所，北京 100101,1 西南林业大学 生命科学学院，云南 昆明 650224,2 军事医学科学院放射与辐射医学研究所 蛋白质组学国家重点实验室 国家蛋白质科学中心 (北京) 北京蛋白质组研究中心 蛋白质药物国家工程研究中心，北京 102206 |
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| 基金项目： | 国家高技术研究发展计划 (863计划) (Nos. 2011AA02A114, SS2012AA020502, 2014AA020900, 2014AA020607)，国家重点基础研究发展计划 (973计划) (Nos. 2011CB910600, 2013CB911200)，国家自然科学基金 (Nos. 31470809, 31170780)，北京市自然科学基金 (No. 5152008)，林业公益性行业科研专项 (No. 201304105) 资助。 |
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| 摘 要： | 蛋白质组学是全景式鉴定、定量蛋白质,并研究蛋白质功能的学科。基于高分辨质谱的鸟枪法蛋白组学研究技术首先利用不同的位点特异性蛋白酶对复杂蛋白质样品进行酶解,进而利用质谱获得蛋白质相关的定性和定量信息。为了获得高质量的质谱信息,前期的样品处理和质谱数据采集同样重要。本文对蛋白组学中常用的Trypsin、Lys-C、Glu-C等位点特异性蛋白酶的酶切特点进行了总结,并综述了目前常用的几种酶切组合策略和样本预处理技术在提高蛋白质组学研究效率中的作用。
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| 关 键 词： | 蛋白质组学，蛋白质水解酶，多种酶组合技术，过滤器辅助样品制备技术 |
| 收稿时间： | 2015/8/20 0:00:00 |
Application of optimized multi-enzyme combination and sample pretreatment in proteomics |
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| Feilin Wu,Mingzhi Zhao,Yao Zhang,Zhi Xiong and Ping Xu.Application of optimized multi-enzyme combination and sample pretreatment in proteomics[J].Chinese Journal of Biotechnology,2016,32(3):306-316. |
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| Authors: | Feilin Wu Mingzhi Zhao Yao Zhang Zhi Xiong and Ping Xu |
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| Institution: | 1 Life Science College, Southwest Forestry University, Kunming 650224, Yunnan, China; 2 State Key Laboratory of Proteomics, Beijing Proteome Research Center, National Engineering Research Center for Protein Drugs, National Center for Protein Sciences, Beijing Institute of Radiation Medicine, Beijing 102206, China,2 State Key Laboratory of Proteomics, Beijing Proteome Research Center, National Engineering Research Center for Protein Drugs, National Center for Protein Sciences, Beijing Institute of Radiation Medicine, Beijing 102206, China,2 State Key Laboratory of Proteomics, Beijing Proteome Research Center, National Engineering Research Center for Protein Drugs, National Center for Protein Sciences, Beijing Institute of Radiation Medicine, Beijing 102206, China; 3 Institute of Microbiology, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100101, China,1 Life Science College, Southwest Forestry University, Kunming 650224, Yunnan, China and 2 State Key Laboratory of Proteomics, Beijing Proteome Research Center, National Engineering Research Center for Protein Drugs, National Center for Protein Sciences, Beijing Institute of Radiation Medicine, Beijing 102206, China |
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| Abstract: | Proteomics is a powerful subject focusing on large-scale study of protein structures and functions. A complete enzymatic digestion of protein complexes is the key step in modern high-resolution and high-throughput mass spectrometry (MS)-based identification and quantification. To achieve MS analysis, both peptide sample pretreatment and data acquisition are prerequisite?in proteomic studies. In this paper, we summarized both the enzymatic proprieties of three common proteolytic enzymes, Trypsin, Lys-C and Glu-C, the optimization of multi-enzyme combination and an advanced sample pretreatment in proteomics research. |
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| Keywords: | Proteomics proteolytic enzyme multi-enzyme combination filter-aided sample preparation |
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