籼稻基因组中的tRNA研究 |
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作者姓名: | 王希胤 史晓黎 郝柏林 |
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作者单位: | 1. 北京大学生命科学学院,北京,100871;中国科学院基因组信息中心暨北京华大基因研究中心,北京,101300;河北理工学院数理系,唐山,063000 2. 北京大学生命科学学院,北京,100871;中国科学院基因组信息中心暨北京华大基因研究中心,北京,101300 3. 中国科学院基因组信息中心暨北京华大基因研究中心,北京,101300;复旦大学理论生命科学研究中心,上海,200433 |
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基金项目: | 国家重点基础研究发展规划(批准号: G2000077300)和北京市248创新计划资助项目 |
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摘 要: | 在籼稻基因组的127551个重叠群中, 共发现了596个tRNA基因, 其中有3 个携带硒代半胱氨酸的tRNA基因和一个抑制型tRNA基因. 除了上述4 个特殊的tRNA基因外, 592 个tRNA可按密码子分成45 种, Guthrie等人提出的修正摆动假设完全成立. 在这些重叠群中, 还发现了27个假基因, 但未发现trnT-CGU基因, 这可能是由于现有序列数据的不完备. 在上述592个tRNA基因中, 可能存在冗余, 而且还可能再有新发现. 研究了水稻基因中密码子的使用与tRNA基因的数目之间的关系. 从水稻的两个栽培亚种——籼稻和粳稻的叶绿体基因组中, 各发现了33 个tRNA基因, 经多重联配发现, 两组tRNA基因完全相同
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关 键 词: | 摆动假设 密码子偏好 tRNA假基因 水稻 叶绿体 tRNA基因 |
收稿时间: | 2002-07-30 |
修稿时间: | 2002-07-30 |
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