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鸡Foxp3结构预测及组织表达谱分析
引用本文:常贺,高辉,王永强,高丽,曹红,李晓齐,郑世军. 鸡Foxp3结构预测及组织表达谱分析[J]. 生物工程学报, 2022, 38(8): 2928-2938
作者姓名:常贺  高辉  王永强  高丽  曹红  李晓齐  郑世军
作者单位:中国农业大学动物医学院 农业动物流行病学重点实验室, 北京 100193
基金项目:国家自然科学基金(32130105);现代农业产业技术体系专项(CARS-40)
摘    要:本研究旨在克隆鸡foxp3 (chfoxp3)基因全长编码区序列(coding sequence,CDS),并对其进行生物信息学及组织表达谱分析。以50日龄无特定病原鸡为样本,从脾脏组织中克隆chfoxp3基因全长CDS序列,利用在线工具和软件对chFoxp3进行生物信息学分析,以实时荧光定量PCR (quantitative real-time PCR,qRT-PCR)技术检测chfoxp3基因在鸡各组织中的表达分布情况。研究结果表明,chfoxp3基因包含882 bp的开放阅读框,编码293个氨基酸,chFoxp3分子质量为33.44 kDa,属于亲水蛋白;chFoxp3具有Fox转录因子家族典型的forkhead结构域,含有核定位信号;其二级结构由α-螺旋(29.35%)、延伸链(10.92%)、β-转角(5.12%)和无规则卷曲(54.61%)组成;chfoxp3在不同组织中表达有差异,在鸡心脏及胰腺中表达水平较高,显著高于脾脏、法氏囊以及胸腺等免疫器官(P<0.01),这一特点明显区别于哺乳动物;通过系统进化树分析发现,鸡Foxp3与其他野禽属于相同分支,但与哺乳动物相差较远。这些研究结果为进一步深入研究chFoxp3的免疫调节功能奠定了基础。

关 键 词:  Foxp3  克隆  表达分析
收稿时间:2022-04-08

Analysis of the structure of chicken Foxp3 and its expression profile in tissues
CHANG He,GAO Hui,WANG Yongqiang,GAO Li,CAO Hong,LI Xiaoqi,ZHENG Shijun. Analysis of the structure of chicken Foxp3 and its expression profile in tissues[J]. Chinese journal of biotechnology, 2022, 38(8): 2928-2938
Authors:CHANG He  GAO Hui  WANG Yongqiang  GAO Li  CAO Hong  LI Xiaoqi  ZHENG Shijun
Affiliation:Key Laboratory of Animal Epidemiology of the Ministry of Agriculture, College of Veterinary Medicine, China Agricultural University, Beijing 100193, China
Abstract:
Keywords:chicken  Foxp3  cloning  expression analysis
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