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去势和非去势公猪背最长肌circRNA差异表达分析
作者姓名:邢宝松  王璟  陈俊峰  马强  任巧玲  张家庆  张华  滑留帅  孙加节  曹海
作者单位:1. 河南省农业科学院畜牧兽医研究所河南省畜禽繁育与营养调控重点实验室;2. 华南农业大学动物科学学院广东省动物营养调控重点实验室/国家生猪种业工程技术中心;3. 河南兴锐农牧科技有限公司
基金项目:国家自然科学基金青年基金项目(编号:31601927);
摘    要:公猪去势可减少异味和打斗,但去势后产肉量和肌内脂肪沉积发生变化,其分子机制的解析对生产具有重要意义。近年来研究表明,环状RNA(circRNA)在肌肉发育中具有重要调控作用。为探究去势后circRNAs对背最长肌发育的调控,本研究选择6头淮南公猪,随机选择3头去势,当体重达130kg左右屠宰,采集背最长肌样品,利用高通量测序筛选差异表达circRNAs (differentially expressed circRNAs, DECs)并进行KEGG功能富集分析。结合前期筛选的公猪去势相关miRNAs,构建DECs-miRNAs调控网络,最后使用猪骨骼肌卫星细胞验证候选circRNA表达谱及其与miRNA互作关系。结果表明,去势和非去势组背最长肌样品共获得5866个circRNAs,两组之间共有370个DECs (|log2Foldchange|> 1, padj<0.8),KEGG富集分析表明,DECs来源母基因主要富集于肌肉发育、肌纤维类型转化、能量代谢等相关通路。构建的DECs-miRNA调控网络共包括69个circRNAs和8个miRNAs。选择circRNA

关 键 词:环状RNA  去势  公猪  背最长肌
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