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基于InDel标记分析305份中国甘薯登记品种遗传多样性
作者姓名:唐芬  赵路宽  苏一钧  肖世卓  袁蕊  翁宗宽  戴习彬  周志林  陈艳丽  曹清河
作者单位:1. 海南大学南繁研究院(三亚南繁研究院);2. 江苏徐淮地区徐州农业科学研究所/江苏徐州甘薯研究中心;3. 海南大学热带农林学院/海南省热带园艺作物品质调控重点实验室
基金项目:国家甘薯产业技术体系(CARS-10-GW);
摘    要:对甘薯育成品种进行亲缘关系评价,是了解其遗传背景并有效利用种质资源的重要前提。利用本课题组前期开发的23对InDel引物对305份中国甘薯登记品种进行基因型分析,共扩增出56个条带,其中53个条带具有多态性,多态率达94.6%。多态信息量(PIC)、Nei′s遗传多样性指数(H)、观测杂合度(Ho)和期望杂合度(He)的平均值分别为0.4098、0.4451、0.6003、0.4460。群体结构分析表明,群体数在K=2时ΔK达到最大值,K=4时有个小高峰;北方薯区和长江流域薯区在2个组群内均匀分布,南方薯区大部分(72.97%)汇聚在组群2。主坐标分析(PCoA)中南方薯区有部分汇聚,整体没有划分出明显的簇群。聚类结果将群体划分为4个主要类群,北方薯区和长江流域薯区的品种在类群Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ中均匀分布,南方薯区主要(77.03%)集中于类群IV,这一聚类结果与群体结构研究、主坐标分析基本一致。通过系谱分析筛选出登记品种的13个主要亲本材料,各育种单位存在重复利用亲本进行正反交培育的情况。本研究将分子标记结果与系谱信息相结合,初步表明中国甘薯登记品种的亲缘关系较近,遗传背景狭窄,为甘薯的...

关 键 词:甘薯  登记品种  InDel  遗传多样性  群体结构
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