一株新的沙门菌烈性噬菌体IME-SAL1的分离、全基因组测序和比较基因组分析 |
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引用本文: | 康怀兴,徐晓蒙,张湘莉兰,王亚慧,米志强,童贻刚. 一株新的沙门菌烈性噬菌体IME-SAL1的分离、全基因组测序和比较基因组分析[J]. 生物技术通讯, 2015, 0(3): 311-315 |
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作者姓名: | 康怀兴 徐晓蒙 张湘莉兰 王亚慧 米志强 童贻刚 |
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作者单位: | 中南大学基础医学院;军事医学科学院微生物流行病研究所 |
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摘 要: | 目的:分离鉴定一株沙门菌的烈性噬菌体,观察其形态大小,完成全基因组测序,分析其基因组结构和进化关系,为治疗沙门菌感染提供新的策略和实验依据。方法:以沙门菌SAL95作为指示菌从医院废水中分离噬菌体,分离到的噬菌体经浓缩和纯化后采用透射电镜观察其形态大小,提取噬菌体的基因核酸并完成全基因组高通量测序,分析其全基因组的结构特征,通过比较基因组分析研究其进化关系。结果:从解放军307医院未经消毒处理的废水中分离到一株烈性沙门菌噬菌体。电镜观察显示,该噬菌体头部呈立体对称,有一不收缩的长尾。其基因组全长113 183 bp,比较基因组分析确定该噬菌体为一株新的沙门菌噬菌体,命名为IME-SAL1。结论:从医院废水中分离到一株烈性沙门菌噬菌体IME-SAL1,研究了该噬菌体的分类、基因组结构、进化关系,可为其实际应用提供参考。
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关 键 词: | 沙门菌 烈性噬菌体 全基因组测序 比较基因组分析 |
Isolation,Whole Genome Sequencing and Comparative Genome Analysis of a Novel Lytic Salmonella Bacteriophage IME-SAL1 |
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Abstract: | |
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