| 10828条籼稻全长cDNA的分离和注释 |
| |
| 作者姓名： | 谢卡斌 张建伟 向勇 冯旗 韩斌 储昭晖 王石平 张启发 熊立仲 |
| |
| 作者单位： | 1. 华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室,国家植物基因研究中心,武汉,430070
2. 中国科学院国家基因研究中心,上海,200233 |
| |
| 基金项目： | 国家重大科技专项“功能基因组和生物芯片”(批准号:2002AA2Z1002)项目国家自然科学基金(批准号:30321005)项目资助 |
| |
| 摘 要： | 全长cDNA对基因组学和蛋白质组学研究有着非常重要的价值. 以分离籼稻基因组全长cDNA为目标, 从优良的籼稻恢复系明恢63中分离到10828条非冗余的全长cDNA, 其中780条是新的水稻表达序列. 所得到的全长cDNA至少满足以下两个条件之一: (ⅰ) 5′端序列包含粳稻日本晴的全长cDNA所预测的完整的ORF (9078条); (ⅱ) 包含同源蛋白质对应的完整N末端编码序列(6543条). 在分离到的全长cDNA中, 53％的序列比报道的粳稻全长cDNA有更长的5′端非翻译区(5′UTR); 90.28％ (9776条)的序列能定位到粳稻基因组序列上, 92.78％ (10046条)的序列可以定位到籼稻基因组序列上; 8216条序列能与日本晴的全长cDNA序列定位到粳稻基因组序列的同一位置上, 籼粳间cDNA序列的平均相似性为99.2％; 90％以上的全长cDNA能进行GO (gene ontology)分类. 在780条新的cDNA中, 60％以上的找不到任何同源蛋白序列.
|
| 关 键 词： | 籼稻 功能基因组 水稻 |
| 收稿时间： | 2004-11-08 |
| 修稿时间： | 2004-11-08 |
| 本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录！ |
| 点击此处可从《中国科学C辑》浏览原始摘要信息 |
|
点击此处可从《中国科学C辑》下载全文 |
|
