| 一株乙肝病毒的基因组克隆及系统学分析 |
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| 引用本文： | 孙建光,高俊莲,Zarnekow Monika.一株乙肝病毒的基因组克隆及系统学分析[J].微生物学杂志,2006,26(1):14-19. |
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| 作者姓名： | 孙建光 高俊莲 Zarnekow Monika |
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| 作者单位： | 1. 中国农业科学院,农业资源与农业区划研究所,北京,100081;Abteilung Virologie,Universit't Rostock, Schillingallee 70, 18055 Rostock, Germany
2. Abteilung Virologie,Universit't Rostock, Schillingallee 70, 18055 Rostock, Germany |
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| 基金项目： | 德国癌症研究项目会项目 |
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| 摘 要： | 乙型肝炎病毒HBV的基因分型在基础研究和临床治疗中具有重要意义。PCR扩增并克隆了来自蒙古的乙肝病毒HBV199的全长基因组。分析表明HBV199基因组全长为3 145 bp,属于基因型D。HBV199与乙肝病毒基因型D代表菌株x02496的基因组序列差异为1.9%;与参比菌株AF280817和AY161157具有更高的亲缘关系,它们的基因组序列差异分别为1.1%和1.5%。不同于所有其他HBV基因组,HBV199基因组缺失了HBc-ORF处nt 2021~nt 2057之间的37个碱基。
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| 关 键 词： | 乙型肝炎病毒 基因组 克隆 系统学分析 蒙古 |
| 文章编号： | 1005-7021(2006)01-0014-06 |
| 修稿时间： | 2005年7月1日 |
Genomic Clone of a Hepatitis B Virus Strain and Phylogenetic Analysis |
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| SUN Jian-guang,GAO Jun-lian,Zarnekow Monika,Schaefer Stephan.Genomic Clone of a Hepatitis B Virus Strain and Phylogenetic Analysis[J].Journal of Microbiology,2006,26(1):14-19. |
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| Authors: | SUN Jian-guang GAO Jun-lian Zarnekow Monika Schaefer Stephan |
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| Abstract: | A full-length genome of HBV199 from Mongolia was amplified and cloned. Genomic analysis showed that the HBV199 genome has a length of 3 145 bp and belongs to HBV genotype D.Phylogenetic analysis indicated that HBV199 has a genomicDNA sequence difference of 1.9% with the HBV genotype D representative strain x02496.HBV199 has a relative high DNA sequence similarity with reference strain AF280817 and AY161157,their genomic DNA sequence difference are 1.1% and 1.5% respectively.Different from all other HBV genomes,HBV199 has a 37 bas pair deletion of nucleotides nt 2021-nt 2057 in the HBc-ORF. |
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| Keywords: | hepatitis B virus genome clone phylogenetic analysis Mongolia |
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